EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01090 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:43011099-43012265 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NEUROD2MA0668.1chr1:43011388-43011398GCCATATGGT+6.02
ZNF384MA1125.1chr1:43012184-43012196ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr1:43012185-43012197TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr1:43012183-43012195TATAAAAAAAAA+6.92
Enhancer Sequence
TTCGCAGTCC ATTAAATAGT GCTAATGTTG TTTGTAAGGC ATACTTACAT GCGATTTCAG 60
ACTGAATACT CAAAGTAGCG TGTGGGAACG AGTTGTCACT GAACGAATGT GGGAATATAA 120
AACCAACTTT ACCTCAGTTG TTCAGCTAAA TAACGGTCAC TATGTCTGTC TACCGTTAAA 180
GCCTGTCAAT GGAGCTCAAA AGGGAAATAA CTCGAGTACT AGGACAGAAA AGCGACTGGT 240
TTATTCAACA GGTTAATCGG CTTGTGACAG GACTAAACGC GACGCCTGGG CCATATGGTG 300
TTTTATCAGA CTGAAGAGCT CGTGGCATAT GGTCTCTGTT TATGGTACTG TAGTAAACCA 360
AGAACTGACT GAACATGTCA TTAACTGTTC CTAAACATCA GATTCATGTT TATCTACATA 420
TAATCAGGCA TATTTATGTC CTCTTGTTTC TTATTCATCA CGAATATAGT GTTGTGTATG 480
ACCTAAAACA TTAATTTCTC TCTTTTGTTT GTGTGATAAA TCAAATGTCT GACATTTAAT 540
AATAAACAAT CATGACTTTA AACCTCCATG CCATCAAATC AAACCTCAAA CGAAAGCATC 600
AGCAATCTTG AGCATTTCCC GAGTGATTTA TTGACTGGCA TGTGCCGAGC TTTGTGCCTA 660
TACAAGCAAA TAATACTGAA AATACACGCG CCTCGTCCAG AAATGCGACT ATACAGTATA 720
TTTAAAAGGT TAATCTTTTA CCCGGTCCAG ACATCCGGAA GCATGAATGG CAGAGGGGGG 780
TGTTGTTTGA ACCTACGTCC AATCATATTT ATGCTTTCAA CCTCTTTTCC GACCAGTCCC 840
GCCTCATTTG TTGCGTGAGT GGCTAGACGT AAAAGTTGCC GACCAATCAC AGGTCTTCAA 900
TACGAGACGC ATGTTTATCA TTATCTTCTA ATCATATTAT ACACTGTTTA ACATTTCCTC 960
AGTAAATTTA AAAGGGATAT TGATATACAT ATTGCTCTTT TTGTTCTTTA TATTTGGAAA 1020
ATGTACCCCA CATCTTTTGG CGCTGTGTTT ATGTTAAAAA GATTTGGTAT GATGCTTCTG 1080
TTTTTATAAA AAAAAAAATG TACTCTTTAA TTTTAATTTT GAAAAACGTA ATTTTAGGAT 1140
ATTTTAATTA TGATAATTTG AATAAC 1166