EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01086 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:42658325-42659449 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:42658865-42658884TAGCGCCACCTAGTGACAG-6.6
CTCFMA0139.1chr1:42659129-42659148TAGCGCCACCTGCTGACAA-6.75
CTCFMA0139.1chr1:42658558-42658577TAGCGCCACCTGCTGACCA-7.18
CTCFMA0139.1chr1:42658998-42659017AAGCGCCACCTGCTGGCAA-7.38
Enhancer Sequence
CGACACCAAA ATTGGGTTTT GTCATCTAAA GGCCTTGGCG ATGTTAAATT GCGAAGCTTT 60
AGAGGTTTTG TCGATGGGCG TGTCCGTGGC GGCCTCACAA ACTTTAACGA TTCGCCACAA 120
AACCGGAAGT CATTATAACT CAGGCATGCA TTATACGATC TGCCTCAAAA TTCACATGTT 180
TAATAAGAGT CCTGACCAGA ACAAGTTTAC ATGCCGATAT CCAGATACAG TTATAGCGCC 240
ACCTGCTGAC CACAGAAAAT GTCATGATTT ACAAAGTAAT AAACTCATCC CACAAATGTT 300
TTCATATCAG CACCAAATTT GGTTGGTTGT GTATCTGAAA GCTCAAGCGA TGATATATTG 360
TGAAGATCTA GAGTTTTCGT AGAGGGGCGT GTATGTGGTG GCATGACAAA CCTCAACGCT 420
TCGCCATGAA AAAGGAAGTG CTTATAACTC AGGCACACAA TGTCTGATCT GCCTGAAACT 480
TCACATGGTT GATTAAATTC CTCTCCTGAA GACATCTAAA TGCCAATATT GAGTCAGTCA 540
TAGCGCCACC TAGTGACAGA AGGTAGTTTT GCTTATAACT CAGCCACACA ATGTCCAATC 600
AGCCTGAAAC TTCACAGGGT TGATAAAAGT CCTCTCCTGA AGACATCTAC GTGCCAATAT 660
TGAGTCACAG TCAAAGCGCC ACCTGCTGGC AACAGGTAGT TTGGCTTATA ACTCAGCCAC 720
ACAATGTCCG ATCTGCCTGA AAGTTCACAT GGTTGATAAA AGTCCTCTCC TGAACACATC 780
TCCATAACAA CATTGAGTCT GTCGTAGCGC CACCTGCTGA CAAAAGGCAG TTTGGCTTAT 840
AACTCAGCTA AACAATGTTC GATCTGCCTG AAACTTCACA TGGTTGATAA GATTCCTCTC 900
CTGGTGACAT CTACATGCCA ATCTTGAGTC ACAGTCATAG CGCCACCTGC TGAGAGGAGG 960
AGGTTTGGCA TAAATCAGTG ATTTTCTCAG ATTTTTTAAA TATATCAGCT TAAATTATTA 1020
CTGTTCGCTG TTCTCTGTCA TCCTGAGGCC ACCGGGCGGC GGTGAGCCCG GGTGCGAGGT 1080
CCCTATCATC GCTGCTTGCA GCTTTAATTA TTCTTCTTCT TCTT 1124