EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01080 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:41587617-41588583 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:41587711-41587722TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr1:41587708-41587719ATTTTAATTAA+6.62
PHOX2AMA0713.1chr1:41587712-41587723TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr1:41587712-41587723TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:41587712-41587723TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:41587712-41587723TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
CACAATATTT TATATGAAGT TTTAGCACTC GTCTGCATGT GTTTTACGTT TGAACAACTA 60
AATGATTGCT TCAGCTTATT TAAAGGATAT TATTTTAATT AAATTACATT ATCGTTGATG 120
TAAAAGGCAC TTTATGAATA TGGAAAGTCA CATTAAGTTA ACCCCTGCGC TGGACGTTTA 180
TCGGTGGCTG ATAAACACTT GCTGTGAATA TAAGTTAGCC TATTAAGTGC ATTATAACCC 240
CAAAGACATA ATTACAGCAT CTCACGTAAA AAAATAAAGA ACTATAAATG GACGCCCTTT 300
ACGTTAAAAG TTAATGTTAC GCCAGTATGG GCACACATTC GACAACCTCC TAAGACAGTC 360
AGTAGTGCCC TAACGCTAGA CCAAATCGTT CTATAACAAA ATCAGTATGT TACTGTCCGT 420
TCACAACTAT CTAAACGCAT GCTTAATGTT AACCACAGTA AAAGCCACGG TAAATTCACA 480
AAGGACTGAG CTAACGTTAG CAACGAAGCT TTTTTCGTTT GGAATGGCGG ATCACGGACA 540
CTGTCGTCAC ATCAAAGAAA ATGCTTATTC TCTTGAAAAT AGCCATTTAC TTCATTAAAA 600
AACATTATAT ATCAAGTCTA CATAACTACA TTCTTGCTAA AAAGAATATT TAATATATTC 660
TGCGACATAA AAACGAGATT TGTCAAACCG TGTGTAACGT TAACTGTTAG CTTAACTTGC 720
GAGCGCGCTC GAAGGCTGGT CGCTGTCAAA TTTAAAAACG ACCAAAATAG ACAGTCCGAA 780
CGAGAGACCA TTTTATGCGT TTATGTTACC CACAAAGTTT TCTTTAATAA ACAGTCTGGT 840
ACAATATAAA ATGTGACTTA CTGTGCAAAT GGATGTACAG AAATCCGGCT CTGGCGTCTT 900
GCTTCCATCT GACTGGATTC TGTAAACCTT CCTTTGGGCT TTGGCGCCGA GGCAACGGAA 960
CATAAC 966