EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01059 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:40927482-40928627 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RESTMA0138.2chr1:40927560-40927581CGCGCTCTCCATGGTGCTGGA-8.3
SRFMA0083.3chr1:40928300-40928316TGTCCTTATATGGTCA+6.92
SRFMA0083.3chr1:40928300-40928316TGTCCTTATATGGTCA-8.11
TBPMA0108.2chr1:40928392-40928407GTATAAAAGCCGAGC+6.23
Enhancer Sequence
TCACCAATAA TTCTTGGAAC ACAGACTGCA GGCCGTGAAC TATAATTGTA GAATAGAGTA 60
GCCTGCTATT TTCAGTTGCG CGCTCTCCAT GGTGCTGGAC AGCAGTGCGC TTTTACCGCC 120
AGCTCTGCGC GACGCAGCCA TTGCATCTCC ACAATCTTTT TCTTTGGGAA AAACATATTC 180
CAGGGGCCGT TTTGTTTAAC GTTGTACAGT ATAATTACTT TTGCACACAA ATCGTTATCT 240
ACGTATATTA TGATAACCCA CGGAGCGTGC ATATGGAAGT TTTTGCACAT GCACAAAAAA 300
GGTCTATTAT CAGATCTTGA ATTCTGGAGG GAAAGGGGAC AGCAAAGGTT TTCCAGACTG 360
CTCAAGGGAG GTAACAATTT AATAATATAT TTTAATAATT GCTTTTGCCA TTTAAAGTAA 420
ATTGGAGCAC TGCTTTTTAC CCAATAACTT CTTATTGGCA TGTTCGCACA GTCGAGTTTG 480
CGTTTTTATG CTGCTACAGC ATGGCGTGAG ATTTAATAAA GTTTCACTTT AAACAAAATC 540
AAATTAAATG AGCTGAAATT CGTTGTCGAC GTTTAAACTT TGTTTGCAGA CGGAAAATAA 600
ACGAAATAAT TAAATAACTC AAAGAAACAC CTTGCGTTTA TTCGTTCATT ATATCTACAA 660
AAAATGCAAT CTAACGCTTA GAGATGTATT TGGAATTAGC GATAAGAAAC ATACATTGCC 720
GATGCATGGC GCTCCCTCGT TTCCTTACAC TTAACGACAG ACTTATCGAA GCGTCAGAAC 780
CGTAACTCTC CTTTTTTGGG GAAGCCCGTC ATATCCTCTG TCCTTATATG GTCACGAAGA 840
TGACACGCAG CGGGGAATCC TCTCACTGGA GACAATGAAT GGGGAGGAGG GCTGATCGCC 900
GAGACGGAGT GTATAAAAGC CGAGCGAAGG GAAGCCGCTA GTGTGAGAAT CAACAGATCT 960
ACACATCTAC AGATAGCTGG AGAGCTATAT TACCTTGACG CAGATCTCAA AAAGGGGAAT 1020
TCCAAAGTAT TTACATTTCT TTTCTGGACG TACGCCTTTA CGGACTTTAC TGTCGGACCG 1080
TTCTTGCTCT TTCTTGAGTT TGCAATACCC TCTGATCAAT AACCTGCTCG GACTGATAGC 1140
CATTG 1145