EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01052 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:40789881-40791000 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr1:40789972-40789984GCAATCACTGCA+6.14
MEF2AMA0052.3chr1:40790376-40790388TCTATTTTTAGA-7.22
MEF2CMA0497.1chr1:40790375-40790390GTCTATTTTTAGACG-6.23
MEF2DMA0773.1chr1:40790376-40790388TCTATTTTTAGA-6.27
Enhancer Sequence
AAAATAATTA AAGGAGAATC TTGAAGGAAA CCACTGTGAA TTTTCTTTCT GGGTTGTGAT 60
ATCATTCCTT CTGTAAGAGA GAAAATAAAG AGCAATCACT GCATCTATAT TTTGGATTTG 120
ACAATAATGT GAGTAACAAT GTTTTTACCA CATGTCTACT GCTTTTCTGT TGACATGCAT 180
TATTATTTGA TAATAGGAAC TGACTGTTCA TACGGAGTAC CCACAATACC CTATTTTATT 240
ATGCTAAACT GTTACCTATT TCTAGCAGTA TGTGTACTTA TCACCAAGCA TTATTATTAT 300
TAATATTATT TGTATAAAAG ATGTCTAATA GACGTCTGAA ATACTCCAAA AACCGACTAG 360
GCATCAAATG CATTTTACGT GTAGTCGCTC ATTCCTGTCT GTTTTATAGC TAGTCTGTTT 420
TTGATGCAAT ATTAAACGTC TACTCGATTT TTACAATTTT AACAGCCCAA ATTTCGTCTT 480
AATTTGGCCT TGACGTCTAT TTTTAGACGT CTTTTAAACA GAAAATGCAT GCTTGGTTAT 540
TATGGCAAAG TCTTGAATTC AGCACGTGTC AAAATGTTTC AAAATTGGTC AAATACAGGA 600
TGGAAAATAG ACAGTTTCTA TATCATGCTG TTTTTGATGC ATATATATCA TAAGATATGA 660
TAAACGAATG AATAATAAGA AGGATAAATG AAGACCCACT TACGATTTGT CGGTCTTCTG 720
GTTCTGATGT AGAATGTCCG TGAATTGTAA TACTCACTGT GAACAGCAGG TGGTGTGCGA 780
GGACAATAAA AGCAGAGCTC ATCGGTATCT GAGCTATATT AGCAGGTTTG TCTGTTTAAA 840
ACGTCTGCTA TGTTGTATGT ACTTTAGAAA TCGCGATTAA GTGATGAAAA ATTTTTTTAA 900
ATAATGATTG TTAACTCGTG TGTTGTCTGT CACTTCTTTC AACCTGCCGT GCCTTCAAGT 960
CAAGAGTAGT TGCCCGGCTA GCTCAGTCGG TAGAGCATGA GACTCTTAAT CTCAGGGTCG 1020
TGGGTTCGAG CCCCACGTTG GGCGCAGAAC ACTTTTTTTC ATTGAGCAAC TGGTGGTTTT 1080
CATTGTGATT GGCGGTGCCT TCCTCTGCTT CATAGGTCA 1119