EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01046 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:40488675-40489603 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr1:40489150-40489163ATAACCACTTAAC+6.87
Sox3MA0514.1chr1:40489118-40489128AAAACAAAGG-6.02
mix-aMA0621.1chr1:40489492-40489503CCTAATTAATT-6.32
Enhancer Sequence
TTTCAGACCA AGACAAAAAA AAATCATATA CAGCTCATGT AACAACTAGC TAAAGACAAC 60
TAGCTTCATT TTCTTTAACA CTTAACATTT AAAACTTAGC TACATTTCAA TTCTGGTGCT 120
AAAACAGCTC GAGTCCAAGT GAATTGCGAC ATCTTGACAC GTGTATTAAC TGTGTCATTC 180
CAATATTCCA CATAACGAAC ATGCCAATAT CCTACATGCC ATCATGAGGT AAAAAAAACG 240
TGACAGCGCT ACATGACAGG ACTTCAAACA TGGTAAGTAC GTTTATCAAA CAAAACGGCT 300
ATTTTGAAAC ACTTTATTCA CCCCAACACT TAAAAGAACA GCGTAGAAAC TTTTCCCAAG 360
CAGAATTTAT AGGATTTACC TGCTACCGGC GAAGGTTTCC GAAGAATCAC CCATCTGTTT 420
TTCCACTGTT AACGTAAGGA AACAAAACAA AGGCAGAGTT CGAACATGGA AACAAATAAC 480
CACTTAACTT TTGGCACAGC AATGAATGAT GCAGTAAAAG TAGTTTGCGT TGCTTTTAAC 540
CACCTTTTTG CCTTCTCGGA GTTTGACTTG TCCCTCTACG ACAACCGTAT CCGTCATCTT 600
GTGTCATGTT TCCCGACAGC TGTGTGCGGT CCGCGGCAGT GAGTGAGTGA GGGGGTCACT 660
TTCAAAATAA CCTCCAGAAT TCACTGTCTG CTCTGCTGTA ACACACACGC AAACTCTCTC 720
TCCCCCACAA TACTCACACA TGCACAGGGC CACCCTCTCT GAACACACAC CAGAACGGTT 780
TTTACAGTTG TCCATTCAAG GTGACAAGTT ATATGCTCCT AATTAATTTA CAACACATGA 840
CCTGGCCATT CTGGCAAGTC TCAGACAGTC AGATCTGGTT TGAGGGGATG GTACATCACA 900
AAAATGTACA GAGAAAAAAA TATTTATA 928