EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01020 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:39868530-39870865 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArMA0007.3chr1:39870592-39870609GGGAACAATGTGTACCA-6.16
ArMA0007.3chr1:39870592-39870609GGGAACAATGTGTACCA+6.67
IRF3MA1418.1chr1:39870492-39870513CAGATTCAGTTTCGATTTAAC-6.33
IRF9MA0653.1chr1:39870493-39870508AGATTCAGTTTCGAT-6.38
NR2C2MA0504.1chr1:39869248-39869263AGATGTCAAAGGTCA+6.45
NR2F2MA1111.1chr1:39869254-39869265CAAAGGTCATA+6.02
NR3C1MA0113.3chr1:39870592-39870609GGGAACAATGTGTACCA+6.56
NR3C1MA0113.3chr1:39870592-39870609GGGAACAATGTGTACCA-6.66
NR3C2MA0727.1chr1:39870592-39870609GGGAACAATGTGTACCA+6.73
NR3C2MA0727.1chr1:39870592-39870609GGGAACAATGTGTACCA-6.96
Nr2f6MA0677.1chr1:39869249-39869263GATGTCAAAGGTCA+7.06
RXRBMA0855.1chr1:39869249-39869263GATGTCAAAGGTCA+6.37
RXRGMA0856.1chr1:39869249-39869263GATGTCAAAGGTCA+6.38
RxraMA0512.2chr1:39869249-39869263GATGTCAAAGGTCA+6.49
Enhancer Sequence
TCATTTTATG TCGACAACTG CCTTCACAGT ACCCCCAATC AGGATGAAGC CAAAGCTATA 60
ATTGATGGCC TACGTGAGTC ACTGTTAAAG GGAGGCTTTG AAATCCGACA GTGGGCGTGC 120
AACGTACCTT CTGTCCTGAA GCATCTTCCA TCAGAGGCTA TATCGGCTAG TAGCGAGTGC 180
TGGTTGTCCC AGAGTAGCTC TTACCTGCAG GAACTCACAC TTGGCTTGCA ATGGAACTGT 240
ATTGATGACA CCCTTGGTTA TAAAACCCGC ATAGCCGAAC CCATCCAGCC AACAATGAGA 300
AACCTGTACA AAACCCTGGC TAGTCAGTTT GACCCCCTGG GCTTTATTAT ACCCTTTACC 360
ACTAGGGCTA AAACCTTGAT TCAGGATCTC TGGAAACAAA ACCTAAGCTG GGATGACCCT 420
ATCGAACCCT TATACTTGCG TGATAAATGG TCCACATGGG TTGCAGAACT GTCCCATATC 480
ACTACAGTAC AATTCGCCAG ACCATACGCT CCTGCAATGT CAGATACTCC CTCCACCATC 540
AGAGAGTTAC ATGTATTCTG TGACGCCTCA GAAAGGGCAT ATGGCTCGGT GGCCTATCTT 600
CAAATCCGGA ATGAGGAGAA GGTCCATGTA TCCTTTGTCC TAGCTCGCTC TAGAGTGGCT 660
CCTCGCAAAT GTTTATCGAT GCCCCGCCTG GAGTTGTGTG CTGCACACTC TGGCGCTCAG 720
ATGTCAAAGG TCATACAAGC TGAGCTTACT ATCCCCATAC ACCAAGTTAC ACATTGGACC 780
GACTCAACTA CTGTGCTGCA TTGGCTAAAG TCAGAATCTT GCCGGTACAA AGTGTTCGTA 840
GGGTCGAGAG TAGCTGAAAT TCAGACACTG ACAGATGTGT CCAAGTGGAG GTATGTTGAC 900
TCCAATAGAA ACCCTGCCGA CCACATTACC AGGGGGCTTA CTTTAGAGGA AATAGCAGGC 960
CCTCACCAGT GGAGATATGG ACCATCATTC TTGACTCAAC CACAGGAAGT ATGGCCAGTG 1020
ACACCCAGTA CAAAGTCTGA ACCTGATATG AATGAAGTCA AACGAGCATC GTTCATTGCA 1080
GCCATTAGAG TTACCCCAAG CCCAGTACCA GCAGACCTCA GTCAGTTCAG AACTTGGAAG 1140
GAACTTCTTC AAGCGACTGT CACATCTTGT GATGGGGCGG CTGACGCTGA AACTACAAAC 1200
GATGCCTCAA AGTATATACA GGCGGAAAAG CTTCTCTTAG CGCATGCTCA GCTTGATTCA 1260
TTCCCAGAGG AATTCAGAGC CCTGAAAGCT GGACAGCCCA TTCCGACAGA TAGCCGTTTG 1320
AGTTCTCTTG CTCCAGAATT CGACAAAGAT GCTGAGTTGA TAAGAGTGGG TGGACGTCTT 1380
CGTCGAGCTG AAACCCTGTC ATTTGATACT ATTCACCCGA TTGTTCTAGA CTCTCACCAT 1440
CAAGTCACAA AGTTACTGAT CCAAGACATA GATCAACAAC TCCATCACCC TGGTGCAGAA 1500
CGAGTACTAG CAGAGCTAAG GCGTCGATAT TGGGTGCTTA GAGGTCGCGA AGCTGTGCGG 1560
AAACACCAGC ATTTCTGTCA GAACTGCCAA TTCTGGCGTG CCAAGCCACA GAACCCACAA 1620
ATGGCCGACC TACCACCATG CCGACTACGT CTGTTTAAAC CACCATTCTA CTCTACGGGC 1680
ATAGACTGCT TCGGACCCTT TCACATAAAG ATAGGCCGGC GCAGGGAGAA AAGATGGGGG 1740
ATCTTATTCA AGTGTTTAAC CACCAGATGT TTGCATCTTG ACCTACTTGA ACATCTAGAT 1800
ACTGATGCCT TCCTTCTGTC TCTACGACGT TTCATATCCC GTAGAGGGAA GCCTGCTGAA 1860
ATACTCTGTG ATAATGGGAC TAACTTTGTA GGAGGGGACC ACGAGTTAAG AGACTCATTT 1920
AAGCAAATGG CCCCAAAGCT TCAGACACAG CTAGCTCAAC AGCAGATTCA GTTTCGATTT 1980
AACCCACCAA ACGCACCTCA CTTTGGTGGA ACCTGGGAGC GAGAAGTGAA ATCGGTTAAG 2040
GCTGCTTTGC AAGTCATTCT TCGGGAACAA TGTGTACCAG AGTCTGTCCT ACAAACCTTA 2100
CTAGTGGAGG TGGAGGGCAT ACTAAATTCC AAACCCTTGG GCTACGTCTC ATCTGACATT 2160
GCCGACCCAG ATCCTGTAAC CCCAAATATG TTACTAATGG GACGTCATGA TGCCTCCTTG 2220
CCCCAAGTCC TTTATGACTC TAACGAGATG CTGGGTAAAC GCAGGTGGCG ACACAGTCAA 2280
GTACTGGCTG ACCAATTCTG GGCTGCATTT GTCCATCGCT ACTTACCAGA ACTAC 2335