EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01011 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:39555283-39556220 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr1:39555627-39555647TGTGGGTGGGTGGGTGTGGT-6.2
RREB1MA0073.1chr1:39555623-39555643TGTGTGTGGGTGGGTGGGTG-7.19
ZNF384MA1125.1chr1:39555489-39555501GTTAAAAAAAAA+6.04
ZNF384MA1125.1chr1:39555492-39555504AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:39555493-39555505AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:39555494-39555506AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:39555495-39555507AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:39555496-39555508AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:39555497-39555509AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:39555491-39555503TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr1:39555490-39555502TTAAAAAAAAAA+6.44
Enhancer Sequence
CCGAAAAGAA TATGCAGTAA AGGGAACGTT GGGTGGATGG ACATGCCTTG ATGCCAGATA 60
TCAGAGGAAA AGGGCAAGAC TAGTTCAAAC TCCTACAAAA CAACAGTGAC CACTACTCGC 120
AAGCTCTGCA GAGGTGAACG CCAAACACTA TACAAGATTT CCAAAGAGGA TGGAACTTAA 180
TCATTTAAGG TTTAGATGTC GTGAAAGTTA AAAAAAAAAA AAAAAAGTTC AACTATTTGT 240
CTGCTTGCAC CAATATTGCC GGTGTGTCAT CTTTTACTGC TGTGCTAGTC CTAAAGGCGA 300
AACCATTTTT GAAAAACACA ATTTTGCATA TTAATGGGTA TGTGTGTGGG TGGGTGGGTG 360
TGGTAATGGG GAAAAGGTAC TACTTTGCAT ATTTCCTAAA GCAGTTTTTG CTTCAACCCT 420
GTTCCTGGAG TTATAGCAGT TCATATTTCG GATGTCTCTC TTATCTGGTT GATTTTCAGT 480
TTTAGAGTCT CTTCTAATGT TCTGAAGCTT CATTTATAAA ATGTTGCATA GAAACCTTCT 540
TAAATATACA CTCACCAGCC ACTTTGTTAG GTACACATTA CTAGTACTAG TAATTGGACA 600
ATTGGCTTCT AAGCTTTTCC ATGGCCAGGT GTGTGTTATT CCGTCATTAT GACATTTACA 660
ACGAGCAAAT AAAAGGTCCA GAGTTAATTT CAAGTTTGCT ATTTGCATTT GGAATTTGTT 720
TGGAATCTGT TAACTGTAAA CTTTTAAGAT GAGAACCAGA GCTGTCACTA TCAGTCAAGC 780
CATCAATAGG CTGAAAAAAA AACATCAGAG AGATAGCAAA CACATTAGGT ATGGCCAAAA 840
CAACTGTTTG GAACATTCTT AAAAAGAAGG AACGCACCAG TGATCACGGC AACACCAAAA 900
GACCAGGAAA ACCACAGCAA CAACTACTGT GGTGGAC 937