EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01001 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:39413540-39414842 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr1:39413571-39413583ATTGTTTATTTA-6.04
Foxq1MA0040.1chr1:39413570-39413581CATTGTTTATT+6.02
POU4F1MA0790.1chr1:39414518-39414532CATTAATTATGAAA-6.23
POU4F3MA0791.1chr1:39414516-39414532GGCATTAATTATGAAA-6.25
Enhancer Sequence
AAAGATTAGA ATTACTGCCA GGCTATTTTT CATTGTTTAT TTAAATTAAT AATGTTAACA 60
ACTGAAACCT AGTGACATTG AAAGAGACAC TAGTCACTTT TGCATTAAGA AACAAAGATT 120
GTCTAATAAT AGCAGGCCAT TAGCAGCCTC CTTTAAATGC TCATTAACAA AATGAATGTC 180
ATTTAAAGTA CCTCGATTAA CCAGCGCATC CTTGTTTTCT TCAAACCTGT CATAAGATGG 240
AGAAACAGGC TGTTTTATTT ACTTTGAAAC ATTCTCCTTG CAGTGTCAAA GATGAGGCGT 300
TTGAGATTTC TTTAGCCCAA CTAACTAGTG GCTCAGAAAG AGCTGCTGTC ACTGGGGCTA 360
ATGTAAACAC TGCAGTCTGT CAACATTACG ACTGAATGTG TGACAGGAAC ACACTCACAA 420
AACTGCTAAG CATCATTAGT AGGATCTGCA CAAACGAGGC CTTGTTATTT AGCACTAAAA 480
TACACAGAAG CGGCACGTAC TCATCCAGCA GGTCGCAGTC TCCGCCGCTG TCTTTGCCCG 540
CATCCGATGA GGCTGCGGCG GCTGCTGGGC TCTTCCTGCG CCGCGGGCAC TTCGCTTTCC 600
TCCGGCGGTT CCCTGACGCG TCCCGTGACA CTTCAGCCAG GTCCTCGCTG ATGTCAGTCT 660
GCCTCCACAC GGGGATCGTC CGCGTTGACC TGTCCCGTAA AACCCTTCCT GATCCCGTGG 720
CGCTTGTCGC GGCTCCATTG GTTTCGGGTG GGCAGGTCAC TTCGGTGTTG AAGCACCCGT 780
CTCCGCGTCC TCTGGATGCC CTGCACGGGC TGGATGCGGT ACTCTGCCCC GCGGATTTCT 840
CTATGGCCGT CTCGCTCTCC GTCTCCTCTT TGTTGCTCGA GAGCTGCGGC TCCATCACTA 900
CCGAAGTTTT TTCCTCTTAT TTCCGAAAAC CTCAGAAATT CTCAACAAAT TGAATCGTAG 960
TGTGAAATAA AGAGGAGGCA TTAATTATGA AAAATGTTGG CTGGCTAACC GCCCCGATAC 1020
GATTGACAAA CATATTTAGT GGACGCTCGT ACTTCCTTTG CAAATTTGGT GCAAAAATGC 1080
AAGTAGCGTA AATCTTAAAC TTAGTCTATT CTCCCTATAA TAACTGTGCA AAATTCATTT 1140
TAAAGACCCA GAGCCTATTT AAAGTTCTTA AAGCTATAGT AAGCCACGCT GTTAGCAGGG 1200
CCCTCCGCTG TCGCTCTTTG TTGCGTCTCC TTTAAGTCGA GATAAAGCCG AAGATGAGCT 1260
CTGCAGCGAC ACGCAGCGAT ACGGCTGTAC GTGTGCCAGA TT 1302