EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00999 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:39368541-39369526 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr1:39369077-39369088GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr1:39369077-39369088GTTTTATTGGT-6.32
ZNF24MA1124.1chr1:39368598-39368611GAATGAATGAACA-6.3
ZNF24MA1124.1chr1:39368594-39368607AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
TTCCCGTGAC AACAGCGCAA TAACGGTCTT TGTAAATAAA GGGTGAAGTT ATTAAATGAA 60
TGAATGAACA GTTTATAGAG CTCAGCTAAT CTTTTTTTAC CTAAAACCAA TTTCTGAAAC 120
TTTAGTCATT GCGGTAATTC GTCGCAACAG ATAAAGTTAC ATTTATGAGG CAGCCGCTTT 180
CTGAGTTTTA AAGTAGGTGC CATCACTGGA AATGTCAGTT TTTCTTCGAG TATGTTCACT 240
CCCTCACCCT CGCGGCGGCG GCGGTTTGCT GGTCTCTCCG TCGCTGTCCA GCGTCGGCGG 300
CTCCCGGTAG TCGAATAGCG ATCGTACGGT CTCCGCCATT CCCGCTGATG AGCGCTGTCC 360
TCTCACGCGC TGCGCTCTCC CCGTCTATGT ACAGGTTCTC TGGGACCGTA CCATTTGCTC 420
AGACACGAGG GGAAGGCGTG CAGCAGGACC CTCAGCGCGG TGGTTCCTCG GTGCATGTAA 480
ATGCTTAAAT TGGTGTGTTT GATCCTAAAT TGTGTATTCA TTAATATTTT AAACCCGTTT 540
TATTGGTAGT GGAATATTAT TCGAACTATT CCAAAAGACA GGAACTCAAA TTTCCCCATA 600
TTAAAGAAAT GGTTGCAGCC TCTAGTATAG GTTGGGGTGG CATTTCTGTT TCTAAGCGAA 660
GTTGATTGTA CTCATCAGAC AGTATTGACA GGTCTGTCTC TGTCAGTGTA TGTGTTATAA 720
CAGATTAAAT CTTTTACTTG CTTTAAATTC AGAACTAACT TCAGTCAAGT GACAACAATA 780
TTCTTATAGG TTTGGTTTTC TCTATGTAGA CTCAGAAGTG TTCATTAACC GCTAGCTCTG 840
TTATAATGTG CGCCGGCTGC AGCTGTGAGC CTGATGTAGA TAAATTAATG CTAAAATACA 900
GAATAAAAGC ACATTTTCAT ATAATAAAGT ATTTATTTTT TCTTCAATAC ATTAATCATA 960
TTCTCTATTT AAACAGAAAT ATTGT 985