EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00937 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:35701429-35702836 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr1:35701937-35701947AACAGCTGTC+6.02
ArxMA0874.1chr1:35702512-35702529ATCGATTAATTAGTTGT+6.05
Hmx2MA0897.1chr1:35701440-35701457ATTGATTAATTGATTGA-6.14
Hmx3MA0898.1chr1:35701440-35701457ATTGATTAATTGATTGA-6.45
Lhx3MA0135.1chr1:35702444-35702457AAATTAATTATTT+6.78
POU4F1MA0790.1chr1:35702445-35702459AATTAATTATTTAT-6.63
Enhancer Sequence
CTGATTTATC TATTGATTAA TTGATTGAAA CATTGTTTAG ACGATAATCA AATAACTGGA 60
TTTTCATATT GGTGTGAACT AACCCTTTAA AGGTCGAAAA AAGGACTTAT GTTGCTTATG 120
TGAGACTAAT AGCTAAAGCC ATGTACTTTG TTCATCTGCT AGCTGACTCC TATAGTGAGT 180
GTCAACTGCA TATTGAGAGA GAGGTTGCTG TGAATTACTG CTACTGAGAA GAAAGCGATG 240
ATTTTCTTTC TCTCACACAA AAACACAATA TCTGTCTTCT CTCACACACA TTCCTGATTC 300
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTAAATAT CCTGCACACT CCCACATGCA 360
CGTCGCATTC GCAATCTTTC TTTTTACTCT TTATCTCGAG CTTTTCCTCT TTCCCCGTCA 420
CATTCTGGTG ATGCATCCTT TGTCCCTGTG TTCTTAGAGC AAGCTCGCAG TGACTGTGTT 480
GGTGGCACAA AGGAGCGCTG GGTATTAAAA CAGCTGTCTC TGGTGGTCCG GATGTAATTG 540
GGATTGTTAA CGTGCTCGGC TCCTGAGGGA TGCTCGTGAG AATGTCTTTG TGTAAAGCAC 600
ACAAGCTCCA CAGCAGCATA CCTTGATTTT GATGTACGTC AAAAAAAGCA AACAAGTCAC 660
CTGAGCTACT GTACATCAAG TCTGGCTGTT ATTTCCCCCC TCCTCCTTTT TTATCCTCCT 720
GTTTTGGGTT GTTGCTTCTG GTGCACTGTT ATTTATATGT AAAAGAAAAT GTCTGTGAAG 780
CTCAATTTTA GTCAGAATTC CTATGAGAGC ATCCTTTCTT TCTTATTGCG GAAAATAAAA 840
GTGTGTTTAT GAGTGTGCGG ACATAGCTTT TGATGGTGGA GAAAAATCTT TGCAAATCTG 900
GCAGCAAAAA AAAAGCACCT TTCTGGTAAT ACAAATTGAA GCACAATATT ATCAAATGAA 960
AGCCAGGTAC AGAAAGAAAT GAAAAGAGGT TAAAAACAGC AAACGAATTC TTAAAAAATT 1020
AATTATTTAT TGTTTTGCAT GTGTTAAAAA GCTAAACGTC TAAACAAGTG AAATTATATT 1080
CAAATCGATT AATTAGTTGT ACATTGTGCA CATAGGGCGC ACCGCGCAAA TGACGCGTAG 1140
TGTTTTAGCT GAGGTCAGAT TTATTTTAAC CTTGTGTATT ACAGCTGAGC AACGATAAAT 1200
ACACTTCATA ACGCTACAGT GAGTAGAAAA AAAGAAAGAA AAAATACTCC TCAAACTCAA 1260
TCGCCTCAGA ACGGAGCCCG GTTGATTTAT TTGACGTTAG ATATACTTTT GTGTGCTTCA 1320
TTGTGAATGA AAATTTCATT TGCCGATTTA GGGGTGGTGA AATATAAATG ATTTCGTTAA 1380
AGTTTCATCA TAAATCAGTC TTTGGGT 1407