EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00895 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:33878096-33880639 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GRHL2MA1105.1chr1:33880460-33880475GTAAAACCAGTTCTT+7.08
POU4F1MA0790.1chr1:33879453-33879467AATTAATAATGCAA-6.28
POU4F1MA0790.1chr1:33879217-33879231AATTAATAATTCAC-6.41
POU4F2MA0683.1chr1:33879451-33879467CTAATTAATAATGCAA-7.26
POU4F3MA0791.1chr1:33879215-33879231TAAATTAATAATTCAC-6.19
POU4F3MA0791.1chr1:33879451-33879467CTAATTAATAATGCAA-7.24
Enhancer Sequence
CCGACTGTGT ATTGTGAAAA GGCTTTTGTA CCCTTTTTCC CCTTCAGTTT ATGTTATGGT 60
TTATTTTCTT ATGCTAAAAA CAATAAACAT TTATATATTT AAAAAATGTT AACTTTGAAC 120
TTTATATTTG CAAGAAGATA CGAAAGCTAA ATCAGGACAT GTTTTAACTC CTGGTTTTTG 180
ACCGTGTAAA CACAGAGAGC GTGAAGTGTC TGTATGGAGC AGTCAGAGGT AAAGCATTTA 240
TCAAGTCTTC TTCAATATGC CTCTGCTACA TTCCGCCTCA GACTGTAAAA CAGCGCTCAT 300
ACCACAAGCT GAAAACAGAC TTTGCTGACA GGTGGAAAGC ATGCTGGAGA GATTGCTCAG 360
CCTTTCCATA TAAATGCCAC CCAATTATCA TAAAACCGTA ATCAGCAGAA AAGAATAAAT 420
CAAGACTCAT TCATACTCTC TACTCAGGGT AACGTCGACT GGAGGAATGA ACATGAGGCA 480
AAATAAAAAC ACTCACTGAC ACACATACAG TACATCTACA TACACACATT CTGAATGCCA 540
GAGCTCTTTA AGTGCTCTTT ACGCGGCTGC TACGCATAGC TATTTCTGGA TTTAGATCTT 600
CCAGCTGTTC GCCCGACATG TATCTCTTTC ACAAGTTTTC AGATTGAGGC TCGGCGTTGC 660
TGGGAAGTTT CAGTTCGGAG CGCGAGAGCA GCGCGCGTGG GTGCGGAGGG GGAGTCAGTT 720
GTTGACGGTC CGGTAGCCAA GAAACCAACT GCAAGCAACT GACAGGAGTC TGTGCGCTAC 780
CCGACCCAGC CCAGACTCCC CTGCCCTAAA GCCACGGGGA AATCCCAAAA CATCACAGAA 840
TTCTTGATTC TTAACACGGG ATTCTTAAGC TGAGGACACT TTCGAGTTGA GATATTGAAC 900
AATGATGAGT TTTCAAAGTA GCTATTTGTG AGGTTGGCTA ACGAGCGACA TGATTGTTGT 960
GGTAAAGATT TTTTTTAAAG AATTTGGAGA ACATTGTACT GAAATTCCCA ACACACGTCA 1020
GAAACGCATA ATAATACCAA AAACGTACAA TTTCATATAG GCCTAACATT TCTGTAGCCT 1080
ACATATAATA AAACAACGCG GATCAGGATT TAACAGTCTT AAATTAATAA TTCACCGTAA 1140
AACTTTCTAT GTTGTAAATT GTCAAATAAA TAAATACATG AACACTCATC TCACTGTAAG 1200
CAAAATGTGA CATATAATAG TAATAATAAT ATTGCTTTAT GCGTTAACAA TGTACAAAGA 1260
GACAAAATGC AGACTTTAAT GCTCAATTGT AGGCTAAATA TATATATTTT TTTATCTGCA 1320
TAATGGACAA GATGCCTGTT TTAAAACCAC ATAAGCTAAT TAATAATGCA AAAGTTTGGT 1380
TTTATTTTTA GGGCATTCAA AGATAGTAGG CTAATCTGTT TTTAAATCTA GAAAATTATC 1440
TAAAATGATT CTTCGCAACA GAATAGTTCC TCAAATGAAA GAATCGCACA TTGCGAGACC 1500
ATTTCATGGG GCATGATGCT GATGGGACTG CAGGCGTGCA GCATGTGCCG CATCATCTAC 1560
ATCGGCCCTC CTTTCACTCG TTGATAGCTT TATTTCATAG GCATTCAATA ATATCCACTG 1620
TCTTGAGCAC AATGAAAAGG CAAAACTCCA AATTACCTGA GAATAGTCGT TGGATAAGCC 1680
CCTTTCCGAG TCAGGATTCT TGTGTTCAAA GCAAAACAGA GAGGAGTCCT CCTGAAAGCC 1740
GTCGGACAGT GAGGGTTTAA GAAGCGAGAG AAAGTCATCT TGTCCCGGTG CGAGCGCAGC 1800
GCTCATGGTA AGAAGCGTAG CGGCCATAAA CCCGTGGATG TGACCAAAAG GGCGTCCGCA 1860
AGATGTGTTT TGATAGACGT TGAGAAAGGA GTGGTGAGTG TATGGTGCAT GGAATGACAC 1920
CCGTGCGTGG ATGTGCGCGC GCTTTCGGTA TAATGTCCCG TTTTGCCTCG CTTCGTTCCT 1980
GGAGCTCCAG GATTTATAAA GATTCAGCGA AAGGGCGGAG TCGGCGACTG AGAAAGTGAG 2040
GCGGCTACAC CTTTACTACT GCTGTTACTG TAACAGAGAA ACAAGCCCGT CAAAACAGAG 2100
AGCCCGAGTT AAATACGTCC AGCCCAGTAA GTTACCTCCC TTACCATCTG GAAAATGACG 2160
GCAGTGCAGA CAAGGCTGCT TAACAAAAAC AGACTGAACT GCATAAAAAC GAGTGCGCAT 2220
CATTTTTATT GACCAACTCA AAGCTCGTTT GGTGTTGCTC ATTTTGTAAA CATTGTATTT 2280
ATTAGATCGG TTAGTAAGTT TCATTAACTG GCAATGTTAA TCAACAACTA ACACAAGCTA 2340
ATTGTGAAGA CTCAATAGTA AGTAGTAAAA CCAGTTCTTA TTCACAAACG CCCGATTCCT 2400
GAACAATATG ACTCTTGTCA GTCGATCGGA TCTTTTTTAA GTCATTATGA AATCGAAATT 2460
AATAGCACAT TCTAAAAAAA TCTATAGGCT GTTGAAAGTT ATGACAAAAA TAAACACACC 2520
CAATGCTAGT TAAAAACATA AAT 2543