EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00891 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:33510118-33510957 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr1:33510404-33510415TGCCATAAAAC+6.14
IRF1MA0050.2chr1:33510900-33510921TTTTTCTTTTTTTTTCTTTTT+6.07
IRF1MA0050.2chr1:33510894-33510915GTTTGCTTTTTCTTTTTTTTT+6.19
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr1:33510728-33510739CTTGAGTGGCT-6.62
RESTMA0138.2chr1:33510334-33510355TTCAGCACTCTGGACAGCGCC+9.28
Enhancer Sequence
TTTAAAAGGG ACTGTTTTAT GAACTACTGA CTAATCTTTT TTGATGGGGA AAATGGGTTA 60
TTTAATGATA TCCCATTAAA TATCCCCTTT TCAACCTTTA CTTTTAAAGA TTACAGTATT 120
AAAGTGCTGT ACAGTTTGTT CTTTTATTCA CTCTACCCTT GATTTAGAAG CGTTTGTTTG 180
GCGTTTAGCT TTTCTGCTGT TGGTGCGAGA TTTGGTTTCA GCACTCTGGA CAGCGCCTGT 240
TCTTGCTGCT CCACCGTTGA GCGACTGCGC TTATACTCAC AGAGACTGCC ATAAAACACC 300
AGTCAAGAGT AAATAAATAA ATAAAAAACA TGAATGGAAC CAATATCTTG CACTACTCTT 360
GATTTACAGC CTCTTTCCCC CCGTCTCGCG ATTTTCAGTT GACTTGATAA CCCCGAGTGA 420
CGCGCGGCTC ATTTGCACGA TCTGACATCT TTATTCATAA ATAGCCCCCA TTCACATCTC 480
TCTGACGTCC ATCGACCCTC TGACGAAACC TGCTCTTATA AGATTCACAG TAAGTTTGGC 540
TCAGTCTGAA ATGTGCTGGA CTGCTCCTCT CCCGAGGCGA TAGTGGGCTC TTTGTGCACT 600
GTTGGTGGCA CTTGAGTGGC TGTTGGCTGA TTCAGAAGGT GAGGCACTTT TCTTATGATG 660
TTGAATTCTG ATATAATTGA GTGTGCTGCC CCGCACGCAT ATAAGAATAG CGAATCCTAG 720
AAATGAGCAT GCAATTTAAC AAAGCTTGCT GATTAAAACC TGCAGATTCA AGAAACGTTT 780
GCTTTTTCTT TTTTTTTCTT TTTTTCTTTT TTAAGTCCTG CGCAGCAACA GTTAATGCT 839