EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00878 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:32625330-32626828 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArMA0007.3chr1:32625490-32625507CAGTACACAATGTTCTT-6.29
CTCFMA0139.1chr1:32625432-32625451TTGCCACAAGGGGGCGCAA+7.46
FOXA1MA0148.4chr1:32626275-32626291CATAAAGTAAACAAAC+7.27
FOXC2MA0846.1chr1:32626278-32626290AAAGTAAACAAA+6.62
FOXD2MA0847.2chr1:32626276-32626289ATAAAGTAAACAA+6.3
FOXP2MA0593.1chr1:32626279-32626290AAGTAAACAAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr1:32626276-32626293ATAAAGTAAACAAACCA+7.55
IRF1MA0050.2chr1:32626451-32626472TTTTATTTTCACTTTTTTTTT+7.47
NR3C1MA0113.3chr1:32625490-32625507CAGTACACAATGTTCTT-6.42
NR3C1MA0113.3chr1:32625490-32625507CAGTACACAATGTTCTT+6.53
NR3C2MA0727.1chr1:32625490-32625507CAGTACACAATGTTCTT-6.17
NR3C2MA0727.1chr1:32625490-32625507CAGTACACAATGTTCTT+6.6
Enhancer Sequence
TGACGGAGGT AATTTGAAAC AAAGTAACAT ACCAATTATT AGTAGAAGTT TGCTGACAAA 60
ACTACTGTAA CTTGGGAATT TAACAAGAAA TACTAAAAGG TTTTGCCACA AGGGGGCGCA 120
ACAGGAGTCA AATTCTCTAC AGAATACATG GGAAATGTGC CAGTACACAA TGTTCTTCAA 180
CTAGACGTGT TTTCTTTTTA ATTTACATGT CACAACAAAC TATGGAAAAT AAAAGTTTAC 240
AAAATGTATA CAGACTTTAT TGATTAAATA ATTAAATAGA TTCATTACAT AGATCACTGA 300
TAACTTTACT AGGTCTCCAT CTTAAGAAAA AAGATTCATA ATTTTGAAAA CTACATATCT 360
GACATTGCAC AATTATGATT TACTGAACTA GAAAATAAGT TGCTGTAATT CCGCTGTCAT 420
GTGGTGTAAA CATTATGGGT GTTGGCTGCA TGCGGCCAAT TTTTTTTGTG AATGCAAATA 480
TGCCTGCAGG AGATAACTTG ACTAAAGAGA GCCTGTCGAA TTACTTGCAT AAGCTAAAGA 540
CTAAAAAGCT TCAGTTCTAA CCTTCTACAA ACATAGGCTA CTTCTCTAAA GCTTATGAAG 600
CTTGCTAATA TTAGAGGCTA TCGCTAATTC ACTCTCTCTA GCTGGCAGGC CAGTGTTCTT 660
CACACATGCG CAATACATTC TCGCCATGCC ATTGTTGATG GTGTTAGTTT ACCGGCTCAC 720
ATATGCTGAC AATGAAAAAA GAACAGGGCC AAAGCAGTTG GGTGTGACTG ACATTAACCA 780
AACAGAAGGA ATTCTCACAT TTCACTTTAT TAAATATGAT CATAGATCGC CAAAAAGACA 840
ACGTTTTAAA ATCAAAGAGT GGTACAGAAA TTAAGTAAAG TAAGCAAATT TTGCAGATTT 900
TTAATAAACC AACACTAGAG AATGCTAATG CTAAAGACAC TGTTTCATAA AGTAAACAAA 960
CCATCACTCT AAGGTTGAGA TATACAAGAG ATTACAACAA TAACAGGGTT TCTGCAGGTT 1020
TCACCAAGTT AAGTTTAAGA CATTTTTTGA GACCATTATG AATTAAATTT CTTTGTTTCT 1080
TTGTCTGAAG ACTCACACAC ACATAATTAC ATTTTACATT TTTTTATTTT CACTTTTTTT 1140
TTAGCAAAAT ATTTCTAATA TTGTGTCAAA ACATGCAAGG TCTAGTTGCA TACACTTTCA 1200
GCAAAAAAGA AAAAAGAAAA AAAAAGACAA ATGTTTTATA AACTGTAATT AACTAAATGT 1260
ATAAACAACA GTCTGAGGTC AGTGTCCTCA ATAGTAAATA CATTTTAACT TTAAAGAAAT 1320
GTTACTGTAA GGTAAATAAA GTTAAAAATG GCATTTTTTT ATTTTTATTT AAAGTTTAAA 1380
TTTTTATTGA GATGGGCTGA GATGGGGATT GTATGGGGGT TAATGGCCAG ATAGGGTAGG 1440
TATACACAAA TTAAAGAAAA TTAGGACCTG TTAAAAATAC ATAAATTAAT TAAGACCT 1498