EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00831 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:30135433-30136157 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr1:30135749-30135766TGATTTAATTAATCAGT+6.36
CTCFMA0139.1chr1:30135580-30135599TGGCCACCAGGGGGCCCCC+6.93
CTCFMA0139.1chr1:30135815-30135834CCGCCACCAGGTGGCGCTT+7.24
CTCFLMA1102.1chr1:30135584-30135598CACCAGGGGGCCCC+6.43
IRF7MA0772.1chr1:30135623-30135637ACTTTCGTTTTAGT-6.18
LMX1BMA0703.2chr1:30135750-30135761GATTTAATTAA+6.02
Enhancer Sequence
AACAAACAAT TAAACTAACA CTACTAGCAT AATAAACTAA CTAGCTGTTT TTTTAATAAT 60
TAGTAAGGTA CTAATTGGGT TTACGTTTAG GTTAGGGCCA GAGCCGGCCC AAGGCATAAG 120
CGAACTAAGC GGCTGCTTAG GGCCCCGTGG CCACCAGGGG GCCCCCAAGA GTGCTTGAAA 180
TTATTGTGTG ACTTTCGTTT TAGTTTGTTG AGTTGTGGAT TAGTGGTGGG ACAAAATATA 240
TGGCCATTTT TAGTGTTATT TCTGACCGCG ATACATACTC GGGCGCCAAG ATATTTACCT 300
AAATTTATAA AAGATCTGAT TTAATTAATC AGTTTTCCAA ACTGACTGCA GCAGATAACC 360
GCTTTAGCTA CAGTACACCT AGCCGCCACC AGGTGGCGCT TCCCGTAATG GCGGATCATT 420
AGACCTACAC CAGCGTCATG TAAACCACTG AGATGAGCTA TTGCAATGGT GAATATCTCA 480
GGCATACAGA CACTTTCTTC TGTCCAAGCT GGACCAATGT ATTTGTGTGT TTCAGACATC 540
CAGCTCCCCC GAATTTGCCA CTAGTTTCTT TCTAACAGAC GCGCTTTCAG TTCGCTATAT 600
CGCTCGCGCG TGCCCGCGGC CAGTGCAACT TCTTACGTGC TCAAACTTTT AACCTCCGCC 660
AAAATATATA ACGATATTAA TAGGACATAA ACATATAATT TGAAGGGCCC TGCGTTTATT 720
TGAC 724