EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00798 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:29985196-29986140 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB3MA0638.1chr1:29985951-29985965CGATGACGTGTAAT-6.11
POU1F1MA0784.1chr1:29985758-29985772TTAATTAGCATAAA-6.37
POU3F1MA0786.1chr1:29985759-29985771TAATTAGCATAA-6.92
POU3F2MA0787.1chr1:29985759-29985771TAATTAGCATAA-6.92
POU3F3MA0788.1chr1:29985759-29985772TAATTAGCATAAA-6.82
Pou2f3MA0627.1chr1:29985757-29985773TTTAATTAGCATAAAT-6.32
Enhancer Sequence
CTCATACACT ACGGAAAACT TAGCCCACCC AATTCACCTG TACCGCATGT CTTTGGACTT 60
GTGGGGGAAA CCGGAGCACC CGGAGGAAAA CCCACGCGAA TGCAGGGAGA ACATGCAAAC 120
TCCACACAGA AACGGTAGCT GACCCAGCTG AGGCTCGAAC CAGTGACCTT CCTGCTGTGA 180
GGCAACGGCA CTACCTACTG CGTCACCTAA AAATATTATA TGTATGGCAA ATTTATATCC 240
TAAATAGAGG GTCTCATCAC TACAATTTAT TTGTGTCTTT TTATTTTTGA CAACCAAAGA 300
GTGCTTAAAC GGTCGGACGT CTATAAAGAG AGAGACGCTT GCTTAGCATG GCACAAGGTC 360
CATTAGACCT TGTTTTATTG GATTTGGCAA CCAAAGTATT GAGTCCCTAA AGAGATAGTT 420
CACCCTAAAA ATGAAAATGC ACTCACCATT TACTGACCTA CATGCATGTA GTTCTGCACG 480
TTTATTCATA CGTTTGCATT ACTGAGAGCA GGAGAGAGAC CGGCTGCACT AGTAGGCAGT 540
AACGTTATCT TCATAATATT GTTTAATTAG CATAAATGAT TAGCAAATGA ATCTGTCTCG 600
TCAGCCTTTA CAAGTGAAGG AATTATCTAC ACACAATCTG AATTCCCCAA TAGAATAATA 660
CTACAAACTA TATAATACTA TTCATGAAAA CACCTAAATA ACAGACTAAT CCAAATGCCC 720
AACACGAGCG AGCTGCGCTC CAGACCAGAT CAGCTCGATG ACGTGTAATG TCTCCGACGC 780
CGCCTGTAGT CCCATTTAGC AACTTGATAG CAAGCGTCTT TTTAAAGAAG CATAACCCAT 840
TAAAAAATTC AAGAGTGTGC TGTAAGTGAT GTGTTTTATG TGGTAGAACA AAACGTGAAA 900
GTATTTTGAG TTTGTGTTTG CCACGAACCT TTTTTAAGCG ATTT 944