EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00792 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:29970668-29973493 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BCL6BMA0731.1chr1:29973166-29973183TGCATTCCTATAAAGCA-6.75
CREB3MA0638.1chr1:29971959-29971973CGATGACGTGTAAT-6.11
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POU1F1MA0784.1chr1:29971766-29971780TTAATTAGCATAAA-6.37
POU2F2MA0507.1chr1:29973154-29973167AACATTTGCATAT+6.21
POU3F1MA0786.1chr1:29971767-29971779TAATTAGCATAA-6.92
POU3F2MA0787.1chr1:29971767-29971779TAATTAGCATAA-6.92
POU3F3MA0788.1chr1:29971767-29971780TAATTAGCATAAA-6.82
POU5F1MA1115.1chr1:29973156-29973167CATTTGCATAT-6.32
Pou2f3MA0627.1chr1:29971765-29971781TTTAATTAGCATAAAT-6.32
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ZNF384MA1125.1chr1:29972502-29972514AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
ATTGTATTTG AAATATTATG CTAACCAGTT AGCATTTTGG CAGATCACCT AGTGCAGCTT 60
TAACTGATGT CACACTAAAG CTCCGATCTG TCAGAAGTCA AACTGTGGCA TTTAAATATG 120
GTCAGTAGTA AAGTAGAACC TATTGTGGTA TTTTCAGCAT TTTTTGTTAG CATGATTTGG 180
AGGGGCTCAA AAAAATAAGC CAATGTTGTT CTTGAAAGTA CCTTTTTGAC CTTTGAAAAA 240
GTACATAGTT AATGGCATAA AGACACACTG AAGGGGAGGT TTTCACTCAT CAAAACAACT 300
AATTAAATAA AAGACACCAA ACATCCCCTA AAAGGTCATT CAGGGTGACA ATAACAGTTC 360
AAGCATCTGA AAAATATTAT TCCTTCATTT TCTTTTCGGC TTGGTCCCTT TATTATTACA 420
CGCCACCGTG GAATTAACCT GCCAATTTAT CCAGCACAAT TTTTACGCAA CGGATGACCT 480
TCCGGCCGCA ACCCATCTCT GGGAAACATC CACACACACA CACACACTCA GTCACACTCA 540
TACACTACGG AAAACTTAGC CCACCCAATT CACCTGTACC GCATGTCTTT GGACTTGTGG 600
GGGAAACCGG AGCACCCGGA GGAAAACCCA CGCGAATGCA GGGAGAACAT GCAAACTCCA 660
CACAGAAACG GTAGCTGACC CAGCTGAGGC TCGAACCAGT GACCTTCCTG CTGTGAGGCA 720
ACGGCACTAC CTACTGCGTC ACCTAAAAAT ATTATATGTA TGGCAAAGTT ATATCCTAAA 780
TAGAGGGTCT CATCACTACA ATTTATTTGT GTCTTTTTAT TTTTGACAAC CAAAGAGTGC 840
TTAAACGGTC GGACGTCTGT AAAGAGAGAG ACGCTTGCTT AGCATGGCAC AAGGTCCATT 900
AGACCTTGTT TTATTGGATT TGGCAACCAA AGTATTGAGT CCCTAAAGAG ATAGTTCACC 960
CTAAAAATGA AAATGCACTC ACCATTTACT GACCTACATG CATGTAGTTC TACACGTTTA 1020
TTCATACGTT TGCATTACTG AGAGCAGGAG AGAGACCGGC TGCACTAGTA GGCAGTAACG 1080
TTATCTTCAT AATATTGTTT AATTAGCATA AATGATTAGC AAATGAATCT GTCTCGTCAG 1140
CCTTTACAAG TGAAGGAATT ATCTGCACAC AATCTGAATT CCCAAATAGA ATAATACTAC 1200
AAACTATATA ATACTATTCA TGAAAACACC TAAATAACAG ACTAATCCAA ATGCCCAACA 1260
CGAGCGAGCT GCGCTCCAGA CCAGATCAGC TCGATGACGT GTAATGTCTC CGACGCCGCC 1320
TGTAGTCCCA TTTAGCAACT TGATAGCAAG CGTCTTTTTA AAGAAGCATA ACCCATTAAA 1380
AAATTCAAGA GTGTGCTGTA AGTGATGTGT TTTATGTGGT AGAACAAAAC GTGAAAGTAT 1440
TTTGAGTTTG TGTTTGCCAT GAACCTTATT TAAGCGATTT TACTGAAACC CCATCGAGAA 1500
AACCCATTGA CTTTGGGAAG AAGGAACCGG AACTGCTAAA ATTCTAACTC GCTTCCGGGT 1560
TTTTGCATAC AAATTGACAT CATAGTTCCT CCACTCAATT AGGAGTAGGC TAGCCTCAAC 1620
AAGACTGACT GCTCATTTAG TCTACATCTA GGCCTATTGA ACTACGTGCT TTAGCATAGG 1680
CCAACGAACT GCAGTACAGA CACCAATTCT CACTTAAGCT CATTTCAGGT TATGATTAGA 1740
CCTGTCCAGT TTCATCTGGA ACGCATCCCA GATGACCTTC TGAAGTGGTT TGAGCGATCG 1800
GATGGATATC TGATCAGAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAACGAA TGAAGTGAGC 1860
AAACAGCCTC AAAAACACAG ACGTGACAGG AATATATATT GAATATAAAT ATATTATATT 1920
CATTATTTGT TAAATATATA ATATTCAATT ACATATAATA ATTAAAAGGA CAAATGCTGG 1980
ACCTTTTGGC AACACTTTTT CAGTTTAGGT CACAATTCAC AGTATTAACA AACAATTAAA 2040
CTAACACTAC TAGCATAGTA AACTAACTAG CTGTTTGTTA ATAATTAGTA AGGTACTAAT 2100
TGGGTTTACG TTTAGGTTAG GGCTAGGCAT GCCCCCACCC CGGCTACGGG CATGATGTAG 2160
TGGAGTAGCA AGTAACATGC TATTAGGTTA TGTGATCGCT AGATGGCGAT CTTGGATAAT 2220
AAGAAGCTTA CCACCACTAG GAGTTTGTCA GAGTCATTGG TCTTTAATTA TAATCATCTG 2280
TCTCCCTATT CTACTGCATC CCAGAATAAC ACACGGCACC AAAAAAATGT AAAAATATAT 2340
ATATTGAGTA TATTTAATAT GTTTTTGTCC GCAACTCGCC GTCACGCCGT GACGGAGATT 2400
CCCGAGCCTG TTTGGTCCAA TGGGAGGCGT GCTCTCCTCA GCGCTCACCA TGACAACGAG 2460
ACTCCCAGCA GTGACGTCGC CATGTAAACA TTTGCATATG CATTCCTATA AAGCACGGCG 2520
GTTCTCGCTC GGTGTTGTCA GTTCTCTCGG GGCTGCCCTT AGAAATTGAC CAAGGTAAGT 2580
TCAAAATAAA CTTCTCTTTC TAAACACCTG TCTCGTGTTT TTATTTGTCA TGTACAGCAA 2640
TACACTGTCA TACAGGTCTG TTGAATGCAT TTGTACGCAA CGTGGTTTGA CAATAAAGTA 2700
GCCTAACAAG TAAATAGTTG TTAAAAATGT ACCTTCATTA GTCAACATTT GGGGAAGGTA 2760
GTAAAAAGTT AATCAAAGAT GTCCTAAAAC ATAATGGTAA TGTTATGGTT GTTACATGAC 2820
TGTAT 2825