EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00785 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:29882794-29883260 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr1:29882979-29882992GAAAAATTAATTA-6.06
Lhx3MA0135.1chr1:29882982-29882995AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr1:29882983-29882996AATTAATTAATTT-6.92
POU1F1MA0784.1chr1:29882794-29882808CTAATTTGCATAAT-8.12
POU2F1MA0785.1chr1:29882796-29882808AATTTGCATAAT-6.92
POU2F2MA0507.1chr1:29882794-29882807CTAATTTGCATAA+6.13
POU3F1MA0786.1chr1:29882795-29882807TAATTTGCATAA-7.22
POU3F2MA0787.1chr1:29882795-29882807TAATTTGCATAA-7.22
POU3F3MA0788.1chr1:29882795-29882808TAATTTGCATAAT-7.22
POU5F1MA1115.1chr1:29882796-29882807AATTTGCATAA-6.14
POU6F1MA0628.1chr1:29882984-29882994ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:29882984-29882994ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CTAATTTGCA TAATTCAGTA ATAAATATGT TGTTATGCAA ACTTCGATTT AATCTTTAAT 60
AAATTTATCA ATTAATCATG CGTCAAAAAG TATTTATACG ATTAGGATAT GTTTCAAAGT 120
GGAGACAAAT TGGGCGGGGG GACTGTTAGA GAGCGCCCTT TTAAAACTGC CGCTCTAGGC 180
GAAATGAAAA ATTAATTAAT TTCTGCGGAG AATCAATTTC TATATTAGAC ACTGCCGGAG 240
AGCGAGCGAG CGAGCGCGCG GGCAGGAATC AGAGATTCTA ATCTCGTTCC AGTAACCTGT 300
GTCACAAACG CTTAACATCT CCAAGCCAGT GCCAAAGGCT GCCTAAATGC TCTCTTTAAT 360
AAGCAAGCAG CCATGAGCTG GTGTCATAAA TTCGCTCTCT GTCAATGAGG TTTAGATAAG 420
CAAACTCATA TTGTTCTTTT AAACAAGGCT CACATAGCTC TCCAAC 466