EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00774 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:29089668-29090806 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr1:29090651-29090662AATAAACAATT-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:29089740-29089753TAAAACACTTAAA+6.33
ZNF263MA0528.1chr1:29090071-29090092CTCCCCCGTCACCCCTCCTCC-6.73
Enhancer Sequence
CATTCTTGTT GAAAAATATT CTGGCCATAA ACATTTTATT AGAACAAATT ATTTTGCCAA 60
TAGAATAGCA TATAAAACAC TTAAAAGCAT AGTTCACCCC AAAACTTTTG TGATCATTTA 120
CTTATCCTAC ACTTGTTCCA AACCTGTTTG TGTTGTTTTC TTACGTTAAA CACAAAGCAG 180
TCATTGACTT TCATGGTATT TTTTAATACC TGCTATGGAT GTCAATGATA TCTCCCAACA 240
TTTTTCAAAA TATCTTGATT TGTGTTCAGC AAAAAAAAGA CGTTCGTAAA GGTTTCAAAT 300
CACTTGAGTG TGAGTGAACT AACTCTTTAC CCTCAACAGA GCTAAATATT ATCTATTTAG 360
AACTTTTTTT GCAAGTCCTC CTGCTGTCTG TAATCCTCTG CCCCTCCCCC GTCACCCCTC 420
CTCCTGCATG CTGTTTAAAT AGCCTTTAAT GGTCGCTGTA GTGGCTGTTT TGACACTTCC 480
TGCGCTGATA GGGCTCTATA AAGCAAAGAT GTGCCGCATG ACACTCCGAT TGTATGGGCA 540
TTACCATCTG TGAACACCTC CTCAACGACC CTGATAACAT CAGCACAGTG ATCACAGTCT 600
GACTCTCACA CACACACGCA AAATCTCTCC TTTAGTCCCT TCTGCTGGAT TTGTCACCTC 660
GGCTTCACTC CATTTAATGC TAGTGTAGAT CTCTGCTGTT AATGTATTTT GACATCTAGT 720
GAGAAAGGAC ATTTTAGTAG TTGCTTCACT ATTTCGGTAA TGGTTTGTAA ACAGTTATTT 780
TGTCGCTGTT TGAGACCTTC GCAGTTGTGT AATTGCAACA ATTGTTTTAA GCAATTAAAT 840
ATGACCTACT TGTCACTAAA TGTGTTGCAG CTACATATAA TAACAGCTCA CACTCTGAAA 900
CCATAACAGC GGCAGTTTTG ATAGAGCGAT TTGTCCTATA ATCAAAATCT CGATTAACTG 960
AACGTTTTAA CTCGATTACG ATTAATAAAC AATTATTTTA TTCTTATTTT TTTGCTCTCA 1020
TAGTTCACTG ATAATACAGT AAATATGCTC ACATATTACA AATCAGAGAT TTTGAATTAA 1080
GTTTGCAATC CTTGATTTTC AAATAATTGA AGGAAACACA CACTATCTAC TATCTATG 1138