EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00770 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:29051974-29053034 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA10MA0899.1chr1:29052118-29052129TTTTTATTACT-6.14
Hmx1MA0896.1chr1:29052202-29052219CCAAGCAATTAAAAGTA+6.09
Hmx3MA0898.1chr1:29052202-29052219CCAAGCAATTAAAAGTA+6.09
ZNF384MA1125.1chr1:29052384-29052396ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr1:29052383-29052395TATAAAAAAAAA+6.92
Enhancer Sequence
TATAGGCTAA TCCACGTCTC TAAAATATTT TGGTTGCATA AATGAATTAG CATTTCGCTA 60
ATGTCTTATA TCGTTTGCGT AATCAACAAG TTGCCATTAA TAAGATTTAA CTCCTTAACT 120
TCTAAATTAG CTTCATTTTA AATATTTTTA TTACTCATTT TAAAACAATA AAAATGTTTT 180
AAAATAAAAA TTGCAGACCG CAATGTTGCA GACTGTGAAA TTGCTTTACC AAGCAATTAA 240
AAGTAAATAC AAAACTACCT TTTGAAAGGT TTTATATTTG TTCAGAATGG TTCACAGAGC 300
AAATTGTGAT GGCGTGCTCA TGTTAATCGA TTTAATTGAT CTCTTTAGAA TTCAACTGCA 360
AGTCAGTTGA TACAGGACAT TTTTGGCTGA TGTGTAAACC ATAGCAAAAT ATAAAAAAAA 420
AACATGAAAG AAAATTTAGT ATGTGCTGCA TTTGTCTTTA TGTAGCCTAT GTACAGCTCT 480
ATAGCCTAAA TTAATCTGAA AGCAAAATTA ACAATTTAGT TCGTTTTTTC TTCTTTTTAT 540
TTTGTGAGTC TCAGATGTTT CAATTGAGTT TTTCATATTC ATGTTATTCA AGTTTTTTTT 600
GCCCTTCATG AAAGGTGAAA AGGGTCAGTT GTTCCATTTT AACCTTTTGA CACTGTTGAT 660
TTTATACTCA TGGCATAGCG GCGTCTCTTC GTCTGTGTAT GTCGCCAATT CAAGTGTCGC 720
CACGTAAATA TGTGTCTAAA GGTTAGATAT CTTCTGAAGA GGAACAACTC ATCCACAATG 780
GAGGGACTTC CCATCTCACC GCCGTTGTCA GGACAACTCG AGCGGTATTC GTCCCCATAA 840
TAAGTTTCAG TTCAAAGCCG GTGACTTACC TCTTTACAAC ACTCTCATGT CCTCCCTCTT 900
CCTTGTCTTT GACTGCTCAT TCTGAGACTT AAGACTTGAG CCCTTGTCCA AATAAGCTAT 960
AGACAAAAGT GTTGGTTTTC GGAGATGCTG AAGAGGAGCA GAGTGTGTTT TCCTATTAAC 1020
TCTAATCTAG ATTCTGAAGG GGTGAAGATA CGAATGCAAA 1060