EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00754 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:28477578-28480305 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:28479036-28479054GGAAGAATGCAAGGTAGG+6.12
RESTMA0138.2chr1:28479983-28480004TTCGCTGTCCGTGGTGCTGAA-9.48
RUNX1MA0002.2chr1:28478592-28478603AAACCACAGAC-6.62
ZNF263MA0528.1chr1:28478148-28478169GGAGGAGGACGGAAAGAGGGG+7.69
Enhancer Sequence
ACAGGTTTGG GTGCGAGTGA AGGATGACAG AATGCTTTTT CTAGGTAAAC TATACCTTAA 60
TAGCACTGTT TGACAGTCTG TAAGCCATTT TGCAGCTATT CTACCTGTTG ATGTAAATAC 120
AGCAAATCTG AGTCAAAGAA TCTAAAACAA TGATAAAGCA GACATCTGTT CTTAGATGCC 180
AACCATGTTA TATCTTTCCA TGATGCGCAG CCTATATGAA CAGTTTGCTT ATTCGCCGGT 240
TTGCTATGAT GAATCGACCT CACTGCATGA GCTGACGCAA ATGACCCTGC ACTCTTTGAA 300
GAACTCTTTC AAAACGAACA TGGCGGCAAC TTAACATCTG GCAAAATGAC TTTGGATCCT 360
TTGGCGAGGA AAGATCCCAC CTTGTCGGAC CGAGGAGGCG AAATTCGGCG TGGTGAAACG 420
AGGAGTCCTT GCGCTTTTCT CCAGAATCAG AGCGAGCGGC CAGACAGTGG CTTTTCCGTG 480
TTGTAGCGGC TCTGCGCAAA CGGTAAGAGC GGAACCCATG ACAGACGAGC AGGGAGAGAC 540
ATGTTGCTAC AGATAGCTGG GTTTTTCTCC GGAGGAGGAC GGAAAGAGGG GATACGACAA 600
TGAAACCAAT AATCCCCCTG AACACAGCGA CTGATCGGAA ATTGCAGTTA ATCGCGGAGG 660
TGAGCAACGA ACGCTCGTTA GCCATCGTTT AGTAGGCAAA ACTCAAGGCA GATCTCCCGT 720
CAATGACTAT TGTGGCAGAA AAGCCCTCAC GGTGGAGTCA GCCAGCGCTG CGCTTTCCTA 780
AAATATGACC AGCGGTGCTC GAAAGTGTCG GCAGCGAGAT AACGGCTTAA AAAATTGGTG 840
TGCTCCCCGC GAGAACGAGA AGCCATTCAC CGACTCCGAG AGGGCCCAGC GATGGCGACT 900
GTCCTTAGCG TCCCTCTTAT TTCTAACCGT TCTGCTTTCT GATCATCTGT GGTTCTGCGC 960
CGAGGCCAAA ATGACAAGGA CCCGAGACAA GTTAGCATCA GAGGACATGA GCGCAAACCA 1020
CAGACCCGAC CTCCATCCAA CACACAGCAG CCTCAGAAGA AACGAAGATG CTATTTTTGT 1080
AGTCAATTCT ACCAAACCTT TGTGGCAACT TGAAACTTGC CAAACGGATA GTTTGTCTGA 1140
AAACTGCTTC ACTTTTGTCG ACGCCGACCA CTTGTGCAGG GGCCTTTCGG AAACGGAGGG 1200
GACGCGGTGG GTGAACATGA GCGATTTGTA CCTTTCCTTT TGTAATTCGT ACTCCCTTAT 1260
GGATTTGCTT TATGGATCAT TAAGTCCGGA CAATTTGAAC TGCAGCCTCG ACGCGGTCAT 1320
GGACGGCGAT CAAAACAGAT GCAGTCTGTG TGTTCAAGCA TACCAGCGTT ACGACCTGCA 1380
CGCACAGGAG AAATATGAGG AATTTGAGAT GATGACAGAC AAATACGAGA CGGATGTGTA 1440
CTCAGTAAGG ACCTGCATGG AAGAATGCAA GGTAGGAATT TATGATCTGG ATCTCTCGCT 1500
TTTGTACAAC AGAGTTGGTT CTTCGTTCTC AGTCGTCATG GTAACTGCTG ACAGTAACGT 1560
GGTGATGATG ATCATGATGA TGATGATGTT TTAGGGGTTT AAAAGTGCAT TTCGCTTCGC 1620
TTGTTGATGG CAACTTTGCT CTGATCTCAT TCGTTGGAAA CTTTTCTTTT GCTTGCTATC 1680
TTATTTTTAT ATTCAATGCT GGGGAGCGTG AACAACACGC ATTGTTCTGG TGTAGTTTTA 1740
CGGAGGCAAA TGAATGTTTC TGCTGATTCA AGGTTACTGT GTCAATGGAC AAAAGCTGCA 1800
AAGCCAATCT TTCAGCGTGC GTGCGTCATT CTATAGCACG CAGGTGCCCG TGTGGCGTCT 1860
CTCGGAACTG AATATAGAGC TGCTCCGCCA GGTGTTCATT CACGTCGTCC ACCACACTGA 1920
GCAGACTACA TTTCAATAAC GCTAATAGGG CACTAGTGCT TTCTCAGCTA ATCTGTCACA 1980
AGAGTCTTTC CCCTCGCTCA TTTGTCGTGT TTGCACAGCA CTCTGCGCTC GCTGCAACAG 2040
GGTGCCCTCT TAACTGCCAT AAACTTGACA TTAAGGTTAA TTTTCGAGCT CCTGCTGTCA 2100
TCTTTAATGG ATTACTCATG GGCGACGAAA AAAAACGACA CTGTGTATAG CTCCTGAGTG 2160
CTGATAAGGA AGCGATCTTG CCTTACTCTT TACGTTTGTG TTGCTGTGTA TAATTAATGG 2220
TCAAACATTT ACCGAGAGCT TGTAAGTTGT CTTTTAAATG AAAGAGACAT AGATAAGCTG 2280
CTGATTAAGT GGGTGGCTTG ATTTGTTTGT TCACTGGTTC AGCTGGCAAA GGACTCCTCA 2340
CAAAGGCTTT CTCACAGCAC CACCACCGAC GCGCCCGCAT AGAGTCCGTC TTTGCTGCTT 2400
GGCTCTTCGC TGTCCGTGGT GCTGAAACAT GCTAAGGTTA AGTTGAAGGG TACATGTTTT 2460
TTGATGCAGG CAGGGGCATG CAGTTTTCTC TAGATCATTA CACCAATGAT AATCATGAAA 2520
ATGGATGTTT GCTTCTACGA TTGTACCTGT CAAAAGCGTT TGAGTCATCT CAGTGAGATT 2580
GTCTTTCAAC TTGTTGATAA GTTATCACAT ATTTGTAGGC TACAATTGAC TTATGCTACC 2640
ACATGATCAG CTACTTCTCA TAAGGAAATA ATCTATAAAA AGAAGTATGA AGTATGTTCT 2700
ATAATACATT TATAAAACAT TTAAATG 2727