EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00709 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:27210963-27212493 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr1:27211669-27211680CATTGTTTATT+6.02
LEF1MA0768.1chr1:27211807-27211822AAAGATCTAAGGGAA+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:27211683-27211696TAAAACACTTAAA+6.33
Enhancer Sequence
AGTTTGGCCA GAGGTAGACT GGTTTATTTT AGAGAAAAAG AATGAGGCAA GAGAAAGCAT 60
AAATCTGGAA AAAATCTATA ATCAAAGGGT CGAAGAAAAA TACAAAGAGT ACACACAGAT 120
TTTTACAGAT GGAGCAAAGA ACCCAGAAAC TGGAGTGTCT GGATTGGGGG TTATTATACT 180
AGCAAAAGAA ATTGAAATAA ATAGAAGGAC ATCTGATAAT GTGGGAGTGT ATACAGTGGA 240
GATGCTAGCC ATGCTAGTAG CATTAAGATG GGTACAATTG ACAGGACAGG AAAAAATTTT 300
GGTATGTTCA GACTCAGCAT CAGCTCTTGA AAGTCTAAGA TCATTTTCTT CAAGTAGACA 360
AGATATCTTG TATGAAGTAC TCCAGTGTAT AACTAAAATA ACAAGTCAGG GAAAGGAGGT 420
AAGATTTATA TGGGTTCCAG GTCATGTAGG GATAAAGGGA AATGAAATGG CTGATAAATT 480
AGCAAAAAGG GCATTAACAA AAGAAAATGT AGAAATGCAA ATAAGGGTTA GTAAAGCAGA 540
AGTGAAAAGT CTAATATGGG TAAGAATAAA TCAAAAGTGG CAAGAGAAGT GGGACAGAGA 600
AAAGAAAGGA AGGCATTTGT ATGCAGTTCA AAAGGCTGTT AAACACAAAA GAGTCAGTAG 660
AGGTAATAGG CGAGAAGAAA TAGTGATAAC AAGATTAAGA TTGGGTCATT GTTTATTAAA 720
TAAAACACTT AAATTGATAC AAAAACATGA AACTGGATTA TGTGAGGGAT GTAGTGAAGA 780
AGAGTCAGTT GAACATGTGA TACTAAAATG CAAAAGGTAT GAAAAGCAGA GGGAGGAAAT 840
GAGAAAAGAT CTAAGGGAAA TAGGGATTCA GGAAATAACA TTAAAAGGTT TACTAAATAC 900
AAAGGACAGG ATTCAGACCA GAATACTTAT AAAGTATCTG AGAGAAACAG GTGTTTATGA 960
TAGGATATAA TAATTTAAGT TATAAGGTAA AGGGAATAAA GTTAAATATA ACCAAGTAGT 1020
GGAAGTAAAA GTAGGGGTAA GAGCAATGTG GTGGTTATTA TTATTATGGT ATTAGTGTAA 1080
ATAGTAGTAT GAGAGTATTA TGGATATTAT AATAACATGG GAGTAGGGGA GAGGTATGTA 1140
TGTAAGTATG TATGTGTGTG TATGAGAAGG GGTGGGAAAG AGGGAAGTGG GGGGAATGAT 1200
TAGTCTGTAA ACCTAACCTC TGGTCCACAC TCCGGAGCTG AAGGTGGCGG TAATGCACCA 1260
AAACGCTGGA TGCCAACCGC CGTAAAATTA TAAGAAGAAG AAGAAGAAGT GCATGTCTAA 1320
GCACAAACCA AGCATGAAGA CAAAGAAATT GTCTGTAGAC CTCGGAGACA GGATTGTCAC 1380
GAGCCACAAG GCTGGAGAAG GTTACAGAAA AATTTCTGCT ACTACAAGTT CCAATGGGCA 1440
CAGTGGCCAC CATCATCCGT AAGTGGAAAA TGTTTGGAAC CAGCAGGACT CTTCCCAGAG 1500
CTGGTCAGCC AACTAAGCTG AGTAATCGGG 1530