EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00643 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:25600114-25601334 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PAX3MA0780.1chr1:25600520-25600530TAATCGATTA+6.02
PAX3MA0780.1chr1:25600520-25600530TAATCGATTA-6.02
PAX7MA0680.1chr1:25600520-25600530TAATCGATTA+6.02
PAX7MA0680.1chr1:25600520-25600530TAATCGATTA-6.02
Enhancer Sequence
TGGGTTTTGT TGCCACAGAT AAAAGCCCAT TAGACACATC TTCCTCTACT TACATTACCT 60
TTCACTAGGC TCTCTCACTC ACTGCAAGAA GACTACAGAA ATTCAAAGCA TTGTGAACAG 120
CTGGTTTTGA ATTTAATAGT ACATCTCCAC CTGAGAGACA ACACTGGATA CCCATTCATA 180
TTCAAGACCC TGTCATTAAT CATCTGAGAC CTCACATGAA TCCAGTAATG TTCTTTATTA 240
AGTTTGTTTA AGAGGCTCAC ACTGCTTTAT AACTTCCTGA TTAAAAGCAA ACAGATCAAA 300
ACTGAGTAAC AGATATAATT TTACACTTAC GAGCACGTGA AGTTTTTGTA ACAATAAACC 360
AACAGGTATT GTATTAATGA CGCAAATGAT TAATCTTCTA TTATAATAAT CGATTAGTTT 420
TTGGTTCACA AGTAGCTCAA ATGTGCCATT AAGCGTCGAT TTGAAAGCAG TAAACAAAGT 480
TCAGGAAATT AGAAATATCC GACACTCAGG GGAGAAAGAA AGAGGTCGAG AGTAGACAAC 540
TGTGCCGTCG ATTGCAGCCG GAGACATTTA GATCAAATTG TATAATGGGA TTTAATCACT 600
CTGGCGCCTT CAAAACCACC CGAAATAAAT AATAAAACAG TGGACATTCA GAAAGCATGC 660
GCCACTATCG CTAAGCGAGA GAAGAAAAAA ATGAAAGAGC ATCACCTACC AGACAATCCA 720
GACACCAGGG CAGCACATTA CTGCGATGAA TGCACAATAA ACACACGCCG AGGGATCACC 780
ACAAAAACAC CATCTTTACG CACAAAACGC CATTCTACAC GTGAAGAAAA GTAGACGGAA 840
AGGTATTTGT TTGCGATGGC GTCCGGGTTG AGCCTGTTGT CCGTGGAGCG ATGACTGGAG 900
GTGAGGTGTC TCCTGTCGCT GTGTGTGGCT GATTGGTGCT GAGGTGAGGA GGATGGGGAT 960
GTGTGGACAC CAACTGATCA TTGGCTGGAA ATTACTATAG AAACACCAGG AGCTCTGGGG 1020
AGGGGGATGA TCATCAATCT CCACCGGGAA ACAGCGTGCT TTCTGTCGCT GTCTGTTTGC 1080
TAACTCTTTA CATTATAGTC TCGGAGATTA CATGTAAGTA GCTTATAACT AATTACAGGA 1140
CTAAGTGTAT TTAAAAGCTG CGACGCAAAA TGTTATCATA ACTGGGTTTC TCTCTAAACC 1200
TGTAAAGTAG CAAATTACTG 1220