EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00639 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:25377612-25379730 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr1:25378610-25378624GTTTTCAATATTAG-6.76
Foxd3MA0041.1chr1:25378220-25378232GTTTGTTTGTTT+6.32
PBX1MA0070.1chr1:25378103-25378115CCATCAATCAAT+6.62
Enhancer Sequence
TTATGTAAGT ATAAGCAAAC TTTGACGGTT TCATTTAATA ATAAATATGT GTCCAGTATG 60
ACCTTACTTT TATAACTCGA ATCAGTGATT TGCGCTCGTA TTTTAATGTG AATGTACCTT 120
AGTGAACGAT CAGAAACTTG ACTTTGAAAA ACATTTTCTA TCCGCTGAGT TCTTCCAGAG 180
ACAACTTTGC CACTGCCAGC ATAAGTTTAC TAAACGGGGT TATATGAAAA CACGCCCTGT 240
GTTTCTTTCA GCCAATCATG GGTACGTGGA TGATACGTCA GACCAATGAG CGATATGGGG 300
GTTGGGTCGC ACGTACTGTT GCTAGGGCAT GGCTTCAACA TTGTTACTAT CACTGACTAG 360
CCAATCATAT GACATTTCGC AATGTGTCAA CATCTTTCCT GTGAATTTCT CTCTTTGAAG 420
TCGTTGATTG GATACAAATG TTTTTAAGGC CCGCCTTTCA TACTTTTCTG TCGTCTTATT 480
GGACACAGAA ACCATCAATC AATTACCAGA TTTTAGTTTA CGTGCAGTCT GCATTAATTT 540
TTGTTGAGAG TCTGTACGAC TCAGAATTGA ACCGTTCATA TCGAGCGTCA TCACTTTTTT 600
GTTTATTTGT TTGTTTGTTT TTATTTTGTT TCTCTCTTTG ATTTATACCT TTTGTTAAAG 660
TGTGCATTCG TTTTTGTTGT GTGTAATTTT ATTTCTGCAA ATACACCAGG ATGGAACTTA 720
ATTCTCTTCT CCTACTTCTT GAGGCAGCAG AGTATTTGGA AAGAAGAGAC AGAGGTATCA 780
TGATTATATC TGCTGAACTA AAACTATTCT TTGTGATATT TCGTTGATTT ACCGGTCGAC 840
TGACACTTAT AAACCTGTCT GTAGATCAAG TGTATCTTCA TTGAAGCCCT GAGGGAAGAT 900
ATGATCTCGT TGTCGTGGGA TTCTAAGTCT GTTAAATAAT TGGAAAGATT TGACTTACCA 960
GCATGTCATT ATTTCTAGCA CTGTTAAAAT GTTGTTTCGT TTTCAATATT AGGTCAAATG 1020
TAACCAGGGG GTGGGGGTGT TTGCTTTACA GTAAGTTAAG TTGAAATCAT GATTCGTCAA 1080
CTGTGAAGCG GGTTGCCATA AAATATATAA ATTGTCCAAC TTTATAACTC TGATTTTTGT 1140
TCATTAAAGC CCATACGTCT GTATTCAATG CTATTTACGT TGACTTTCTC ACTAGAAGCT 1200
GAACACGGTT ACGCATCTGT TTTGCCGTAC GATAGTGACT TTTCCAGAAA GAAAACTAAA 1260
TCACCCATTT CAAGAAAACC CCACAACAAC AGGTAAATAC AATGCAGTGA CATTGCTATT 1320
ATAATGGATG GACATATTAC AACAGTGTAT TCTAACGTTA CATGTATTCG CCATTTTTGT 1380
TGTTGGGCTT GGCTGTGTAT AAACATTGCC ACGCGTACAG CGTCAACTTT CGGCCGCTGC 1440
TGCTTTCCCT TTTCCACTGC TGACATTTGC CTTCAACTCA ATCATTTGTC TTCAACTCAA 1500
TCATTTGTCT TGTTGTAACA CCGGTCGTTT AATTTAGCAC AAACTTTTTG GTGACCGAGG 1560
ACGACTGCAC AAATTAGTTA TCGTACGTGC ATGAAGTAAC TAGAAGCGTA TAGCTATTTA 1620
CTGTACTTTA CATTGTGTTA TGTAAGCATG AATATTTTCA AATATGTGTC AGTGATGTTT 1680
TTTTACACAT CAAAAAACAA ACAATGAGTT GCAACAATGT TTTGACCAAT CATTACATCT 1740
GAACTCAAAA TTGTGTCACA TGCTTATGTC ATAGACAGTA TGCTTATAGT AGTGTGGTTA 1800
GTTTAGGTGT GGTTAAACTC TCACTGCTGG GTGTGGTGTG AGCAGACCCA AGTCAGCTGC 1860
TACAGAGCTT TGACCCCTGG ATCTGTTTTG CTGCATTAGC CCCCTTTTCC TTGCAATGTC 1920
AAAGCAAAAC AGCAGGAGCC CAGTGTGCAG CCCTTCCCCC ACAATATGCA TAGAAAGCAC 1980
TGAAAAAAAG GGGAAATCTA CGGATCTAGG GCTGTCTAAG AAATTCATGA CTTAAATTTG 2040
TTTTAATAAA ATAAAAACAT ACACTCAATA ACGTGCTTCT TATTAAACCC AAATTCCCAT 2100
ATTGAAGCTA ACAAATAA 2118