EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00619 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:24858260-24859517 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr1:24858355-24858365GCACGTGACC-6.02
FOXC2MA0846.1chr1:24859271-24859283AAAGTAAACAAA+6.62
FOXP2MA0593.1chr1:24859272-24859283AAGTAAACAAA+6.62
Foxa2MA0047.2chr1:24858365-24858377ACAATGTAAACA-6.04
Foxj3MA0851.1chr1:24859269-24859286AAAAAGTAAACAAATAA+7.28
Enhancer Sequence
GGGTGGGACA AGACAATAGA CGGGAGAGCG CATGACACAG AAAGACAATA CAAGCCATGC 60
GCTCACATAA CACAACACTG AAGCACACGA CAAAAGCACG TGACCACAAT GTAAACACCG 120
AGCCACGTGC TTTGACAAAA GACGCAAGAC ACGAGCACAC GATGAATGAA AGCACTCACC 180
GTGCGCACAC ACACGCAGCG TGCATGCTTC ATCCCAGCGC CGACCAAAAC AACACATTCT 240
CACTCCCAAC TCGTCATATA CTGACGCTTG GTCAGGAACC CTCGGCGTAA GTTATTGACG 300
CACAGGGTAC CCCTTTAGCG TCACATTTAG ACGTGCAGGG ATTCCCTATA GAATCTGTAC 360
CTGAGCCTGA AGCGTCATAG GGAGACGCTG GAGGCTCGTA TAATTACCAA TAGATGTCAA 420
CGCACTTTTT AAAACCTGAT TTACGCCTAT TATCGCAGTT TTCTTCTTTT AAAAATATGT 480
GATTTTTATT TTGTTCATGA AAAGCGTCTG TAAACTGGGT CGAAACTACT GTATGAATAA 540
ACTTCGGTCC ACGTGACATC CCTTCACGGT GAGTTTAACG CCGCTCTGCT ATTGGTCAAA 600
CTGCATCAAC GGTGAGTTCT CAGATGAGTT CAACTATCAA CATTAAATAG TATGTTAATG 660
CTGCATAATG TATTTTTATT GGAGATTAGT TGGTGTTTAT AAATATTTTA TCATTAACTT 720
TATATTTAAT GAGTGAAAAT ATATTCGGTT GTCCAGTTTA GGTTAACTGT AAAACTATAC 780
TACTAATAAA ACTTTGATTC ATTCATATTA TTTATTATTT TTTTTACTTA AAAAATATTA 840
CATTTCAAGT ACTAAGTTTA AAAATGTTTT TGGCTGATCT TTTTTCATTT TAAATTATTC 900
ATTGAAGTTG GGGTCATTGT ATGTGGCGAT CTATTTTTTA CAGTCTATGC TCGCTATCCC 960
AAGGTTCATT GCGATCCCAA GGTTCACTGC GGTTTTCCAC AAGGTAAGTA AAAAGTAAAC 1020
AAATAAAGAC GATTTGTTGA TAAAGCATGT ACTGTAAACT AGCGACGTTA TCCAATTACA 1080
TCAAGTTCAT TTATTAAAAA CATATTTTTC TCAAATATAA CGTTGGTCAT GCATAGCTCA 1140
GAACAATATA TACATTTTAA GATGAGGAAC AGTGTTACCA GATTGTTGTT TTCCACAATA 1200
GAATTCGTGC AAAATCTTTA TATGATATGC AATATGCAAC TCTAATAACA CAAATGT 1257