EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00595 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:23671125-23672077 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:23671851-23671862ATATTAATTAA+6.62
Arid3bMA0601.1chr1:23672061-23672072ATATTAATTAA+6.62
LMX1BMA0703.2chr1:23671854-23671865TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr1:23672062-23672075TATTAATTAATTA-6.25
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:23671582-23671597GGGGTCAAAACGTCA+6.54
POU6F1MA0628.1chr1:23672063-23672073ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:23672063-23672073ATTAATTAAT-6.02
RarbMA0857.1chr1:23671581-23671597GGGGGTCAAAACGTCA+6.01
RargMA0859.1chr1:23671582-23671598GGGGTCAAAACGTCAT+6.44
Enhancer Sequence
TTAGTTTAAG TTACTGTCCA ACAAGTTGTA AGTGCAGGCG CTTCGTGACG TCAATTTTAG 60
AACCCTCGTT CTAGAATGCA TATGCTGTAG GTCACCTCCA GCTTCCATCA GTTGGTGTAC 120
AGTAGTCGAG CAGTAGTGAT TGCAGATTTA TTATTGTCGA TTATCTAGCG ATTGATTAAA 180
CGATGAGGCT TTTTAGACAT TATCGAGTAC ATCCAATGGT AGAGGTGCAG GAACCCCATT 240
CCACTGCACC TGCACCACCC AACCCTGGCA TTGATATGGA GGTCCAGGAT GATCGTCCAG 300
AAAATCCTGT TGAAACTCCT GTTGCCGGCG AGGGAACGAA GAGAAAATTG TGGAAAGTTG 360
GATCTTTGTT TAAATGTCCT AAAGGACATG CAAAGAGCAC CTCGGGTCAC CAGCAACAAC 420
TGAGTAAGTA ATGTCTGCAA AGCGGGAAAA AGAGAGGGGG GTCAAAACGT CATAAATCAA 480
CTTAATAAAG TACTGTTGAA AAATGTATAT TTGTTTTACA ACATAGACTA TTAAAACTTT 540
AATTATCACC AATTCACATA TAATGGCTAT CCCCTTCATA TGGTATGTAT GTAAAGCTCA 600
AAATGGTCCT GCGGTGTATC GCTAAAATCT GAGTCTGCGA CCGGCTGCTG TTTAGCGGGT 660
AGCCGCGCCT CGCCTTTCGA CGTTACTCAT TATGACTCCA TGTTTTGAAT ACATATTATA 720
ACATAAATAT TAATTAAATT CCACTCACTT TATATAAATA TTTTAAACCA AAAACTGCAG 780
AGTTGCCTAC CGATTGTAAT CCAGAACCAG GTTTTTAGTT AGAGCCCCTA TATAGTTATA 840
GGCCCAACTT AGCTAAGCTA TTTTGTCAAT AACATAAGAA ACTATTCAAA CGTGGTAAAA 900
TAGCATAACA AATCAGCTTC TCTTAATGTA TACTTTATAT TAATTAATTA CT 952