EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00568 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:22470213-22472397 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr1:22470363-22470380ATGCACTAATTAATGTC+6.01
ArxMA0874.1chr1:22470364-22470381TGCACTAATTAATGTCT-6.53
Foxd3MA0041.1chr1:22471244-22471256AAACAAACATTT-6.27
MEF2CMA0497.1chr1:22472043-22472058TGTTATTTTTAGCCT-6.26
RFX1MA0509.2chr1:22471036-22471052TGTTGCTATGGTTACA-6.27
RFX1MA0509.2chr1:22471036-22471052TGTTGCTATGGTTACA+6.28
RFX2MA0600.2chr1:22471036-22471052TGTTGCTATGGTTACA+6.29
RFX2MA0600.2chr1:22471036-22471052TGTTGCTATGGTTACA-6.32
RFX3MA0798.1chr1:22471036-22471052TGTTGCTATGGTTACA+6.19
RFX3MA0798.1chr1:22471036-22471052TGTTGCTATGGTTACA-6.33
RFX4MA0799.1chr1:22471036-22471052TGTTGCTATGGTTACA-6.08
RFX4MA0799.1chr1:22471036-22471052TGTTGCTATGGTTACA+6.41
Enhancer Sequence
CACAAAATAG CTTTTTTTAT GGAACCCTCC TGCACTTAAT TTTAAAGTAA TTATAACAAC 60
TAAACCATTG ATTTAAGCCA TGTCTGTGTT GGCACGGCTT CCATCGGTTT TATTTGAGAC 120
TTAATATTCC ACAAATTATG ATTTGTGAAC ATGCACTAAT TAATGTCTCT CATGAGCAGG 180
AGTAATAAGA GCTGATGTCT GTGTTATTTC ATGAAATGAG GGGGGAGAGG CCTGGACATC 240
CATTTGCATT AAACTCACGG GCATCAAAGG CGCATCGCGG ACATGCGCGC TGACAGCCAG 300
TTATCAGTCT CACGCAAACC CTAGGCTGTC TAAATTATGT CTCTAATGCG ACTTTCGACA 360
TTTGAAAATG TTAAAATATC TACCTTGCAT GGGCTTAGAT CATCCGAGAC GTCCGAATGG 420
CAGCTTTCCA TGAGCTCCGG AGGAAACCTG TTGATCTGAA GGTAAATGTT AGGTGAGAAA 480
TAAGCGCTTA AATATTGATC TTTACGGTGC AGAGTGAGAA CGTAACGAAT GAAGACTGAC 540
AGGCAGCATG CAGTGAAACA TCCTAGAAAT CGCATTGCAC TTGTCAGTAC ACATGAATGC 600
TGATTTCACT TCCTTTTTAG CTGTCGAATT TATTGTATCA AACTGCTCAG CCCACATCCC 660
TTAGAGTCCA TGTTTAAATA GTAGTGCGAG TAAGATTTAA ACCAAACACT AACCTTTTTT 720
GATACGTTTA GGCTGTGAAA TGTATATCTA TGATGATTTG AACAAAATAA ACAGTGTTTG 780
TGTTTTTTTC CTTGAATCAT TCGATGCACG CAGGAAAAGA GCATGTTGCT ATGGTTACAT 840
CATCACGCCA AGGCGATTTC TGTTCGTTCA CTCTCTCATT TTTGCAACTT TTGTGGTTAA 900
ACGTACAAAC CATAATCTGA CCTAAAATGG CAACTAGTTT CACCAAACTT TCATAACTCT 960
GAAGCCGATG TGTTTAATGT TAGACAAAAA CAGCTTTGTT GACATTTAGT GTATACTGTT 1020
CCATGAAGAA AAAACAAACA TTTAGTGAAT CATTTCATTT CACAGAAGTA TATTGTTGAA 1080
ATATGTTCTT TAACCTATTT ACAAAAATAA AAAAACGGTG CGTTATGCTG CTTTAAGTTG 1140
TAAAATGGTA GGCTACTTTA TCAAGATTGA GGCCACCTGT TTGCTAATTT ACATAGGCTG 1200
CTTTCATATC TAGCATTTCA CTGTGTTGTC CACAACACCG CCAGGCGCTT AATGTCCTAT 1260
CAGGTATAGG TTGTAAGGAC ATCTGTCCCG GGTAATTACC GTCGTTCACA GTTTAAGTCC 1320
GTTTACAGCT GCTAAGCCGC CCCGGTAAGC GCATTACCTT AGCAGGGCAG CGCAAACACT 1380
AGCGCTCGCG CAGTCCGTGA TGAGCGCGTG CCGACCGCGA GAACCTCCCG GAGAGGTGCG 1440
AGACTCCAAC CCAGATTACA TCAACATGAA TAACAGATTA CAGCAGGCGT TATCAGAGCG 1500
ATCAGCGAAA TATGAAGTGA ACCGTCACTA CAATTCATAA AGCCTGTCAT CGGTTACTGA 1560
GACAAACGCC AGCGCTGCCA AATTGCGTCA AGAACTGTCA GGTGTCAATG CCGGTTAGTG 1620
ATTAAGATGC TGAAATCCAC CTAAGTCTCG CTTGAGTAGG ATAAGAAAGG AACAAATCTG 1680
TTTGTTTTTG TTGTTTTGTA TTTTAAATAT GTTCCAGAGT TTGATTGTCA TTGGTCCTGA 1740
CATAATTGTT CTTCCGTTTT TGTAGATGTC AGCAAGAAAG TGGTGGTAAT TCAGCACTCA 1800
AAGAATTGAA AATGATGGGT ATGTATGAAG TGTTATTTTT AGCCTTCTTC AGTGTCCTTT 1860
TGTCTCAGTT AGTATGAATA TTACATGTGT TCTGCTGTAC AGATTGTCAT GTGGGCTATA 1920
GTTGCTGTCA TTGCTTGTGT ACATGTGATT AATATATTTA TGTGTATGCG CATTTACACA 1980
GACACACAGC GTGCTTTGGT GGCAGTGGAG CGTCTGCAGG AGAGGCTGAG GAAGAGAGGA 2040
GAGCTTCCTG CTGAAGAAAA ACTCAGTCTG CTTAAAAGTG TCTTACAAAG TCCCCTGTTC 2100
CACCAGATAC TTATCATGCA AGAGACTGGA CAACAGCGTA AGCAGCAGCA GGTCAGAGAA 2160
TATATCAACA TCATTCCAGT CCAT 2184