EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00544 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:21307688-21308294 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:21307993-21308005GAATGTTTTTTT+6.52
LMX1BMA0703.2chr1:21308246-21308257AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:21308245-21308256TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr1:21308245-21308256TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:21308245-21308256TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:21308245-21308256TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
AAATTATGTA TTAATAATGT GAATTATTGA ATTTACCTTG GTTGTAGTTT TGGTGTACCG 60
TGACTGAACT TTCCTGCCCA TTGGCGTTGA GGAGACTCAG CAACATATAG GAGCAAGATT 120
AAGAATCATA TAAAATAAGT ATTAGAGAAT TGTTTTTAAG TCTCAGCGCT ACAATAATTG 180
TTTTTAATTT TCAGATTATG AACAAATAAT GTGGATTGTT AAATTTACCG TGATCATTTA 240
TCGGCGTGCA GTGACCCATC TTTGTTGTTC GTTGTCAAGG AGAAACTTCC GTTTCTGACG 300
AGTTAGAATG TTTTTTTACA GTACAACCAA AAATGTTTTT GTTTAAACGC TGTTACTTCG 360
CTCACGCAAA GGAATGTCAG GAAGAATTTC TTTCTGTCAT TTATCACGTT AGTGTTTTAG 420
TTAAATCCAA ACACAAGAGG GCAGCAAAGA ATTACTCACC GTGCTCCTAC AACAAAATAC 480
AAAATAAAAG TCATAAAATA AGAACATTTG AACCCAACTT CAAAACAGTT TTGTATGAAA 540
ATGTGTTTTT AATTTGTTAA TTTAATTAAT AAGCCACTCT TACAAACAGC AGAAAAATAT 600
AAATCA 606