EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00534 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:21026762-21027354 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr1:21026884-21026895GTTTTATGGCC-6.62
CDX4MA1473.1chr1:21026884-21026895GTTTTATGGCC-6.32
FOXC2MA0846.1chr1:21026980-21026992TTTGTTTACTTT-6.62
FOXP2MA0593.1chr1:21026980-21026991TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr1:21026977-21026994GTATTTGTTTACTTTTT-7.95
LMX1BMA0703.2chr1:21027111-21027122TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr1:21026789-21026803ATGCATTTTTAATG+6.43
POU4F3MA0791.1chr1:21026789-21026805ATGCATTTTTAATGTT+6
PROP1MA0715.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
AGAGACAGAC TGTATAAATA TCTTCTGATG CATTTTTAAT GTTTGCTGAT GAGGCAATTT 60
CGGATTAGCC TATATGTAGA TTGTTTCATG GAAGTTTGCG TGTATTGAAG AAAGCATTAT 120
TAGTTTTATG GCCCACTTTT CATCATAATA CCATTCAGAG ACCAAATGAG ATGAATAAAA 180
AAAGAGGCGT TGTTAACCTT GTTGATTTGC TCTGTGTATT TGTTTACTTT TTATTGTTTT 240
AATTGTCCGC TTTGACTTGT GCGTCTCGGT CAAAAGCGAT TATTTCCGCT TCCAGGAGGG 300
CATCCAAAAT TTCCCCTTAC CAAAAACTAT CCGCGCTTTA ATTACTTTAT TAATTAAATT 360
AAAGAGGAGA CTGAAACGCC ACGTTTTGTA ATCCTATCAC GTAAAGGAGG CATGGGTGGA 420
GCAATGGTGG TAACCGAAAA ATGGAAACCT CTTTAAACAA TTGTTTGCTC TTTAATGGGC 480
TCTATGCACG GCGGCGCGTG ACGCATTTCC GGTAAAATTT AAGACCCCGA GCCTACTTCC 540
GCCGATCGTA CAGTACAGTA CTACAACAGG ACCGCTACTG ATAAAAACGA GT 592