EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00521 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:20365164-20366572 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr1:20365446-20365460TGTCTCAATATTGG-6.02
Arid5aMA0602.1chr1:20365708-20365722TGTCTCAATATTGG-6.02
CTCFMA0139.1chr1:20365292-20365311CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr1:20365554-20365573CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr1:20365685-20365704CTGTCACTAGGTGGCGCTA+6.6
CTCFMA0139.1chr1:20365816-20365835CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr1:20365423-20365442TTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.79
CTCFMA0139.1chr1:20366120-20366139TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
SP8MA0747.1chr1:20365982-20365994AACACGCCCACT+6.07
Enhancer Sequence
AGGGACCTCG CACCCTTGCT CACCGCCGCC CGGTAGCGCC ATGATGACAG AGAACAGTGA 60
ACAATATTAA TTTAAGCCGA TATATATAAA GAACCAGAGA AAATCACAGA TTTATGCCAA 120
ACTTCCTCCT GTCAGCAGGT GGCGCTATGA CTGTGACTCA AGATTGGTAT GTAGATGTCT 180
TCAGGAGAGG AATCTTATCA ACCATGTGAA TTTTCAGCCA GATCGGACAT TGTTTGGCTG 240
AGTTATAAGT AATTTCCTTT TGCCAGCAGG TGGCGCTATG ACTGTCTCAA TATTGGCATG 300
TAAATGTCTT TAGGAGAGGC ATTTCATCTA ACCTGTGAAA TTTCAGGTTG ATCGGACATT 360
GTTAGGCTGA CTTATAAGCC AAACCACCTT CTGTCAGCAG GTGGCGCTAT GACTGTCTCA 420
ATATTGTTAT GTTGATGTGT TCAGGAAAGG AATTTTATCC AACATGTGAA GATTCAGGCT 480
GATCAGACAT TTTGTGGTTA AGTTATAAGC CAAAATTCCT TCTGTCACTA GGTGGCGCTA 540
TGACTGTCTC AATATTGGCA TGTTGATATC ATCAGAAGAG GATTTTAATA AACCATGTGA 600
AGTTTCAGGC AGATCAGATA TTGTAGGGCT GAGTTATAAG CCAAAATACC TTCTGCCAGC 660
AGGTGGCGCT ATGACTGACT CAATATTGGC ATGTATATGT GTTCAGGAGA GGACTTTTAT 720
TAATCATGTG AAGTTTCAGG CAGATCGGCC ATTGTGTGGT TGAGTTATAA GTACTTCCTT 780
TTCCATGGCG AAGCGTTGAG GTTTGTCATG CCACCACAAA CACGCCCACT GCGAAAACTC 840
TAGATCTTCA CAATATAACA TCGCTAGAGC TTTCAGATGA CACTACCCAA TTTTGGTGCT 900
GATACGATAA AATTCGTGAG AGGAGTTCGT TACAGTGTAA AACATGACAT TTCCTGTGGC 960
CAGCAGGTGG CGCTATAACT GTATCTGGAT ATTGGCATGT AAACGTGTTC TGGTCTGGAC 1020
TTTTATTAAA CATGTGGATT TTGAGGGAGA TCTGATAATG CATGCCTGAG TTATAATGAG 1080
TTCCTGTTTT GTGGCGAATC GTCAAAGTTT GCGAGGCCGC CACGGACACG CCCATCGACA 1140
AAACTTCTAA AGCTTCGCAA TTTAACATCG CCAAGGCCTT TAGATGGCAA AACCCAATTT 1200
TGGTGTCGAT CGGATAAAAT CCCTAGGAGG AGTTCGTTAA AATACAACGC CTGGAAATGG 1260
CAAAAACGCC ACTTTTTTAC AGCAGGAAGT CAAAAATATC TGACTTCCTG TTGAGTTTGA 1320
GATATGGCTC CAAGAGACTT TTTCGTATGT TTTGGCATGT TTGAGATGTG TGCCAATTTT 1380
CGTGCGTGTG CGTGATTCGT ATATCAGG 1408