EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00512 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:20168747-20170031 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:20169421-20169431TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr1:20169421-20169431TCTAATTAAA+6.02
PAX6MA0069.1chr1:20169308-20169322CAGTCAAGCGTAAA-6.76
Enhancer Sequence
TCAATTTTGT ATTGCAGAGA TCTACAAGGC CGGTTTTGTT AGCATTTCTG ATTAATGTAG 60
TTAGGCACAT TATGAACATT AGCCATCGCA CTGGCTACAG AAAAGGGGTA AAATAACATT 120
CACGGTCAAG TTCATATGCA GCCTCATTTA AAATTAGAGT CTCACTGACA AATTTACGCT 180
TAAAACCACA TGTAAATAAT ACATACGCGC CTTTGTACTT GATTCCTGAG AACTTTCGTC 240
CAATGTCTTC CATACGGTAT GCTAATCGTT CATGGCCAGG CCACTATACA CTTAACTTGA 300
ACGTTTCAAC AGCGCCCTCT GTTGATGTTC ATGATAAATA TCAATTAATT CTTCCATACT 360
GTATGTCACA TCCATCATTG AAGTTGAGCT ATATTAATTT TCATTTATAT GTCCATAAAC 420
GTAGCTATTA CGCTTCCGTT TCATTCTCGA CAGTAATCAT AACGCCATTG TAAACGTTCT 480
TCCTAAAAAG ACAGAAGGAG AAACAATAAT ACAAGAAAGT GACAAACCTG CCAAAGTAAC 540
TTAAGCCAGG TCTCCAAAAC ACAGTCAAGC GTAAAAGTAA TTGGCCGTTT GTGAAAGTTT 600
GTGCTGCTTA ATGCATTCAG TTTTATATCG GTGTCAGCTC TCGAGGGAGA CTGGAGTGAG 660
TGTGTATTTT TAGCTCTAAT TAAACACATA TCAATGCGAC TCTCCCTCCG CCCATAGAGG 720
GAAGTAATGA GAGAAGCGGG CCTTAGAGAG ATAGAACTGC TGTTTTAGGG ATTCTGGGAT 780
CTCTGTGGAC CAACAGGAGA ACTGCCATAC TGTGGCTGTC TGCTCTCCGA TCAATGGTAT 840
TGATCAGGTT TATGCTAATA GGTAAGGAAT GAATAATGGG CGAGACTTCC TGGATCTGCT 900
ATGCCAGCAA CTAAAGAGAA TAGAGCTGAA TAACTTGTCT ACACAACTTT ACATAACTGC 960
AAAACTTTGA GAATATCAGT GGGAAAGAGG GATAGTTAAA GGGATAGTTC TCCCAGAATT 1020
GAGAAATCTG TCACTAGCCT ACTCATTCAC TTGTTTTATT TATTTCAGCT GAACACAAAG 1080
GAAGATATAC TGGCACAAAG CTGGCTCTAG GCATTGGCAG GGTCTGTGTT GCCCACCCAA 1140
AAAGAGTAGG CCTATACACA TTCATTTATT TCATTTTTGG CGTAGTGCCT TTATTAATCA 1200
AGGGGTCGCC ATAGCGGAAT CAACCGCCAA CTTATTCAGC ATTTTACACA CCGGATTCCC 1260
TTCCAGCTGC AACTCATCAC TGGG 1284