EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00505 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:19858859-19860336 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:19859981-19859993GATTGTTTTTTT+6.44
HOXA10MA0899.1chr1:19859796-19859807AGTAATAAAAA+6.14
ZNF384MA1125.1chr1:19859717-19859729TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr1:19859716-19859728TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
ATAACTAATA TCTGTACATA ACTGTTTTTT TCTGAGACTG ATTCAGTAGT AATGCCACAT 60
GGAGGATATA TTCACACAGG TAAAAAAAAA ATGTAATTAA AATTAAAGGC ACCATTCATA 120
TGTGTGTGCT GAGGAAGGTT TACTTTGTTC CCTAGGCTAT TACTATTAGC TTACTGCTAA 180
ATAAAATGTG TTATTTAGCC TACATATTTT CCAATTAACT TGACAACTGA TCTGGTAACA 240
CAAAAATAAC ATTTCAGCAC ACACTTTTGT GCGGGAGACC AAAATGCCAA CATCAACAGT 300
AATCGGAGTT CTTCTTTAAA AGAAACCTGG CTTTTGCTAG TCCAAAATTC GCATACTGTA 360
GAATTAGGTA AAATAAATGT TCATTATACA AAACTTTGGT ACACTTATAG TTAAACGTGC 420
ATTCAACGCC AGTGTAATCT TATGAGTCAA ATGAAGAATA CTCTGAAATT ACTATTCAAT 480
TGTATACACT ATAACTTACT TAACAAACAA CAAGTAGCGT ATTGAGCTTA ATCCATTTTA 540
GCAGTACAAA CGCCTGTGGG CTGCAGGGGC ATGCCATAAA CTGTAGTTTT TATACCAACC 600
AAACAATACA TTTATCCAGT TTTTACATTC TCCTCATATA TAAAAATGAT TAGTACATTT 660
ACCAACATAT TTAAAATTTC CAGGTTTTAT CTTCCCCACA TATTCATTTA GCAAGAACAC 720
ACAAATGCAA GCATACACTA GATTTAAAGT TTTTGAAAGT ACCTTTAGTG AATAATTTAT 780
CGTAAGTTAC CTCTGCAAAA CCTCCAACAA TTTTTTAAAC TGCAAATGTG ATAATGATTT 840
CCACTGCTTG CATAATATTT AAAAAAAAAA CTTACTCGTC AGAGGCCTTC ATCCTCCACT 900
GAATCAATCC AGTCAACATG TCCAGTCCTC CTCCACAAGT AATAAAAAAG TTGATGCATG 960
GACAAGTTTT GTGTTTGTTC ATTAAAGATG ATCTCGGGAA GTAAATTTCT TCAGTTTTGT 1020
CTGTCTTCAG TTCAGTTCAG AGGCCTGCTT TTAATTTTAA ACATCCCTTC AGCTCCCCCT 1080
GCAGACTGAC TAGCGTTGCT GCTGGTCTAA TCGTCTAAAA TCGATTGTTT TTTTCCAGCA 1140
CATTTCTCCA TTTCACAAAC AAAACACGCA GAACAGACAG CTAGCACTCA AAATTATAGT 1200
ATACACAAAA CTGTTTGTTT TGGCGTTGAC AGCCACAAAC TTTCTGAATA ACGTTAGTGG 1260
TGGTACCGAC GTCACCATAA TTCCAATAAT TTATTAAAAC GAACGTTCGA AGGCTATTTA 1320
AGTCTGGGAC TCCAATAAAT AAAATAGGCA TAGACGTCAT AATAGATAAA TTTATATTAT 1380
ATTGTCTTTG GGTTGAACAC GATACGGTGG CCGAGAGAGC TCAAGCGTCT TGCAAGTAAA 1440
AAACAACAAC ATGCAAATAG AAGAACACTA AAAAAGG 1477