EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00476 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:18808222-18809100 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr1:18809062-18809079ATACATTAATTAATGAA+6.67
ArxMA0874.1chr1:18809063-18809080TACATTAATTAATGAAT-7.39
HNF1AMA0046.2chr1:18808941-18808956AATTAATTATTGACA+6.24
HNF1BMA0153.2chr1:18808942-18808955ATTAATTATTGAC-6.15
Lhx3MA0135.1chr1:18808940-18808953TAATTAATTATTG+6.39
MIXL1MA0662.1chr1:18808995-18809005GTTAATTAGA-6.02
POU4F2MA0683.1chr1:18808939-18808955CTAATTAATTATTGAC-6.35
POU4F3MA0791.1chr1:18808939-18808955CTAATTAATTATTGAC-6.08
POU6F1MA0628.1chr1:18809066-18809076ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:18809066-18809076ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AATTATGGCT ATTCTCCCAT TATCCACAAT GACTAATCTG TTACCTCACC ATGATGCATC 60
GAGATGAAGT TTGTACGGGG TAATTAGTGA CTAAGGCAGG CAAATTTCTA AGGATTGCCG 120
TTTCCCGCTG GATTAAAACA TTCATCAATC GCTCTCTCTC GCTCTCAAAC ACACAATGAC 180
AACAACAAAG ACGAAAGTGC GCAGAATTTA TAAAGAACAA CTCGCATTTT AAAGATTTAC 240
TGTACTTATT TAACGTAGCC TAGTGTTCAT AAAACTTGTC TTTTTCTTTC AGCCTATAAA 300
TAGCCAACTA AGATGAAATT GTAACACCGC CAGATGCAAA ACCTGGAGTT GAGGTAAAGT 360
TTTTTAAATG GCGAATGTTG AAGGTAAAGT GGTTTGTATT TAGACAGGTA ACGTATACCT 420
GAAACAACAC AAATATGCTA AATGAAAAAC AATGTAAATC CTCATGGATG GCTATGTAAA 480
ACACGCAGGC CATTTCAAGA CACTTGTCGG CGGAAGGTAG GCTACCTTCA TCTGTTGCTT 540
CTTGTTACAA TCCATCAGAT AACGTTAACG TTAGACGAGT AAACAAAAAG GCCGTTAGTT 600
AAGAACATGT TGTGCTGATA TTTCACTGTT TATTGTGGTG ATTGTGTTGA CGTGTTTATT 660
AAATTAGCCG TTAGTTCAGT GCTGGAGTCA ATTGACTTAT ACGACTCTAA TTACACGCTA 720
ATTAATTATT GACATATAGC TAACAGATGA GATACGAGCG ATGTAAGTTA CGAGTTAATT 780
AGACATAATA ATTAGTCAAA TTAATATATC ACTGATTATG GCTAATATCA TCTTTTTAAA 840
ATACATTAAT TAATGAATTA TATTTAAAAA AAACTAAT 878