EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00464 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:18259146-18260624 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:18259730-18259748CCTTCCTGCCCTCCGACC-6.08
FOXC2MA0846.1chr1:18259435-18259447ATTGTTTACATT-6.32
HOXA13MA0650.2chr1:18259152-18259163GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr1:18259152-18259163GTTTTATTGGT-6.32
RREB1MA0073.1chr1:18260389-18260409TGTTGGTTGTTGGGTTAGGG-6.09
ZNF384MA1125.1chr1:18260602-18260614AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:18260603-18260615AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr1:18260601-18260613TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr1:18260600-18260612TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr1:18260599-18260611TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
CGTGAAGTTT TATTGGTTAA AAGAGATGTC ATGTAACATT ACTAAGATTT TACTTTATTG 60
GTTAAATATT ATTAATTTTT TTCTTTCTGA CGTGGAAACG TGTGACGATG TTCAAGTTCA 120
AAAGTAAAAC TATCCTAATA AGGAAAAACG GGGATAATAT TTATTTATTC AGGTATATGG 180
GCCCTCTTTT TCTTACTACT TATTGAAATA TTTTCTGTAT TTAACAACAA AGACTAGGTA 240
GAAACATACA GCTTCTGCTG CTCTAATTGA CTTAATACTG AAATCGATTA TTGTTTACAT 300
TTAAATGACC CTCGTCATTC TGTCACCACG GCAACCTGAG TTGGTTTACA AATCCACACA 360
ACTGTCTATA AAGTCATCAA TCCTGATCAG CGCGCTTCCA AACTCTGAAC TAATCTCCTG 420
TTAGCTGACT TTCATCAGTT CGGGAAGTTG TTCATGATGA CTCTGCGTCG TTCAAAGAGG 480
ACCAGGACTC TCCCTGGACA ACTCAAGGAC TTCTTGCTGG AGCGCTCCAA CAGTTGCATG 540
TCAGACACTT CCGTGGAGCA GCGACACCTG CGGAACGCGG CTGTCCTTCC TGCCCTCCGA 600
CCTGCAGCTT CAGTCTCCTC AGTGGGTAAG TGTCCACAGG AGGAGCCCCT CTCCATCCAC 660
GGTCGGAGTG TCCAGGAGTA TCAGCACATT TACCGCAGTG TGGTGGACTC CACCGTGAAG 720
AAGCGCGCAA GACGGTACAC TCCCCAACAA GGATTGGAGG TAAAGCAGCG TCTGTGGGAG 780
AAGCTGGACC GGCCTGCGCT GCTGGAGACC GAGCAGGCTG ATGGACGTGT GTTCATCACG 840
GAGATCAGAT CCGGGTCCAG TGTCCCCCCT CGTATCGTGG TGGACATCAG CAAGGAGCCG 900
CTGCCCAAGG AGCCCCGGAG GAAGAAGCCC AGGCACTAAA CCATCCTAGT GCCAGATGGA 960
GGATCATGGG CACGTATGTA CATACTGTAT ATATTGTATA TAGTTATAGA ATAAGTTTGC 1020
AATACATCAA AATTTCACTT TTAATTCAAG TTTTCATCAC ATTGCTGGAT GTTTTGGTGA 1080
TTGTCTGTGT TGCTGGTATT CGTCTCTTGG GTTGTTGGGT TCTTTGGATG GTTCGCTGTA 1140
GGTTAATATG CGTTTAGCAA GGTTTTCTAG GCGGATTATT GCGTATTGCT GGTCTCCTCT 1200
GAGTGGTTTT TGGCACATTA GTGGTTGTTG TTAGGGTTGT TAGTGTTGGT TGTTGGGTTA 1260
GGGTAGGTTA GGGTCCCTCA CACGGTTTGC AGCTTGACGT GCTGTGAGGG CTTGTGTGCA 1320
TCAGTGATGC TGAGAGCTAT GCCACTGGTA CTTCACAGTT ACCGGTAGGG TCACCCATAG 1380
TGGACAGGTC TCAGCTGAGA TGCCTGACCA AGACAAACCA CCTGATTATG GACTGCAGAC 1440
GATAGGCCTG ACATTTAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAA 1478