EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00454 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:18058726-18059796 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:18059459-18059480ATGAGGAAAGTGAAACTATTG-6.28
IRF2MA0051.1chr1:18059463-18059481GGAAAGTGAAACTATTGG+6.36
Lhx3MA0135.1chr1:18059239-18059252GAATTAATTATTT+6.22
Enhancer Sequence
CCTGCATATA AAGAATCTCT TTAAACCATG TCAACTGCTT TCAATGCGTT GTCCATTTTC 60
TAACTTACAT ACAAATAACC GACAGCTAAC GTTACTGTTA CAGTAAGCTG AGACATCAAA 120
TAACCGCCAT CTAAGTTACC CATTTAATTG AACTCATTTA GACTCAGTTT TAAACTATTT 180
TATTCGTTCA AAAATGACTT TTTTGATCAG TAAAAGTTTC GTTTGACCGT AAGTGTAACA 240
TTTGAACCAT TATTTTATAA TAAACTGACA GGCGTCGTTT CAAAACATAC TGAGCTGCCT 300
ACCTAGACAG CATTAGCGCC TTATGGATAG TTGAATCAGT GCCCAGAAAT GCTGTCTAGA 360
CAAGCAGTTC GGCATGTTTT GAAACACAGC CCACTAATAC AACTCTACCA AGAAAAAGTT 420
CATTATCCGA GATATACATC AAGGCGTTAC ATCAACTAAC GTTGTGTTAT TCACTCTTCG 480
CGAGAGGGAA ATACATTTAA TGACATATCA AGGGAATTAA TTATTTTTCA GAGGGTTAAT 540
GTTCACTAAA CTCTCATTAG TGGCTAACCG ACTAGCTAGC CAGCCATGCT AGCAGACATG 600
GACTTTCCAA CTAAACAAAC TCCGAATAAA CTTTATAAAA GGTACTCACT GCCTCCTGCT 660
CGCTTTTCAC ATCCCTCCGC AGTTTATGGA AGATGTGAAA GCGCGCTTTC ATCGCTTCAG 720
CCATCCAGAG TTCATGAGGA AAGTGAAACT ATTGGAAGTT TGGAGTGTGT GTTGCCGTTT 780
GAACGGCGTT CAGTGGGATG TGACGGTAAC ATTCACATGA TGAGAGAAAA TTACACTGGA 840
GAATCTGATC ATATCACATC CACCGGGATA CAAACGCCGT TTCCGGTCGG TGTCCAGACT 900
GTCATGTGTT CGGGGGGAAA TTGTTAAAAC TCTGAGCTTT AAAAGTATTT TCGTTTAGAA 960
TCCAATGGAG AGAAAGATTA AACATATTTT ATTTTGCAAT GTAAATAAAA CACAAGTTGG 1020
TTTAGTTAAG GCTGGGGTTA TTTAAGATTT TCTATAATTA ATAATAATAA 1070