EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00432 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:17472146-17473152 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr1:17472948-17472960AAAGTAAACAAA+6.62
FOXP2MA0593.1chr1:17472949-17472960AAGTAAACAAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr1:17472946-17472963AAAAAGTAAACAAATAA+7.28
TFAP2AMA0003.3chr1:17472310-17472321AGCCTGAGGCG-6.14
TFECMA0871.2chr1:17472494-17472505CCCACGTGACA+6.02
Enhancer Sequence
TTATGTGTAT GAAGCCTCTG TTTCGTGAGA CAACACATTC TCACTCCCAA CTCGTCACAT 60
ACTGACGCTT GGTCAGGAAC CCTCGGCGTC AGTTATTGAC GCACAGGGTA CCCCTTTAGC 120
GTCATATTTA GACGTGCAGG GATTCCCTAT AGAATCTGTG CCTGAGCCTG AGGCGTCATA 180
TGGAGACGCT GGAGGCTCGT ATAATTACCA ATAGATGTCA ACGCAATTTT TAAAACCTGA 240
TTTACGCCTA TTATCTTAGT TTTCTTATTT TAAAAATATG TAATTTTTAT TTTGTTCATG 300
AAAAGCGTCT GTAAACGGGG TCGAAACTAC TGTATGAATA AACTTCGGCC CACGTGACAT 360
CCCTTCACGG TGAGTTTAAC GCCGCTCTGC TATTGGTCAA ACTGCATCAG CGGTGAGTTC 420
TCAGATGAGT TCAACTGTCA ACATTAAATA TTACGTTAAT GCTGCATAAT ATATTTTTAT 480
TGGAGATTAG TTGGTGTTTA TAAATATTTT ATCATTTACT TTATATTTAA TGAGTGAAAA 540
TATATTCGGT TGTCCAGTTT AGGGTAACTA TGCCTAATAA AACTTTGATT CATTCATATT 600
ATTTATTATT TTTTTACTTT AAAAAAATAT TAAATTTCAA GTACTAAGTT TAAAAATGTT 660
TTCGGCTGAT ATTTTTCATT TTAAATTATT TATTAAAGTT GGGGTCATTG TATGTGGCGA 720
TCTATTTTTT ACAGTCTATG CTCGCTATCC CAAGGTTCAT TGCGATCCCA AGGTTCACTG 780
CGGTTTTCCA CAAGGTAAGT AAAAAGTAAA CAAATAAACA CGATTTGTTG ATAAAGCATG 840
TACTGTAAAC TAGCGACGTT ATCTAATTAC ATCAAGTTCA TTTATTAAAA ACATATTTTT 900
CTCACATATA ACGTTGGTCA TGCATTAGAA CAATATATAC ATTTTAAGAT AAGGAACAGT 960
GTAACCAGAT TGTTGTTTTC CACAATAGAA TTCGTGCAAA ATCTAT 1006