EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00395 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:15817850-15818697 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:15818162-15818173TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr1:15818161-15818174ATGATTAAATTAT-6.16
HOXC12MA0906.1chr1:15818129-15818140TTTTTACGACT-6.02
HOXD11MA0908.1chr1:15818129-15818139TTTTTACGAC-6.02
HOXD12MA0873.1chr1:15818129-15818140TTTTTACGACT-6.62
Nkx3-2MA0122.3chr1:15818414-15818427ATTAAGTGTTTAA-6.19
PHOX2AMA0713.1chr1:15818618-15818629TAATTCAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr1:15818618-15818629TAATTCAATTA+6.14
SP2MA0516.2chr1:15818274-15818291CAGTGGGCGGGACTAAT-7.53
Enhancer Sequence
GTAAAGATTT ATTATTGGTA AAATGCTTAT ATTGGGAACT GGTAATAAAT CAGATTCACT 60
CAACACTGGA AAACTGGGAC ACCAGAAGCC TATACAAGTT TATATAACTG ACCTTTAGTC 120
TGACATACTT TGTTGTTTGC TGATTGTGAT CGATTGTGTA TTTAATAGGC TCTTCAACGA 180
TTTCTAAACG AAATGAGATA CAGTTGAATT AAATAATTCA AATGACTTTT GAACTCTTTT 240
TTTAAACCCA CTATCAGATG TACCCCGTCT AACTGGTCGT TTTTACGACT GTTTCATAAA 300
TGTTCAGCAT TATGATTAAA TTATTAGACA GTATTTGCAC AACTATTACA CACACACACA 360
CACCCGTAAA TATTCTGTAA TTCATTTACA GATCAGATCG CAGACAGTGG TCTGGTTGCT 420
TCTGCAGTGG GCGGGACTAA TACGTAAGCT CTAACCTCAT TGGCTAGTCG CACAGCGGCA 480
AACTGGATAA ATCTGTTTAA GTTACCGTGA GATCATGTCA GGATTGTGAG GTAAGATTTA 540
AAGAACAATA ACATGTTCAT AATCATTAAG TGTTTAAATA GATAATTTAG CGTGTCGTTT 600
ATACTTAGGC TAAGTAGTGT TTTATTGAAA AAAATGCAGA CTTTCACACC CGCCTTAAAT 660
ATACATACAG GCCTATTACC ACGATGCGAA TTATACATTA ACGATTTGGG GGGTCAAGCT 720
TAAAGATTTT GTTCGGTAAT GTGCCTCAAT TAACCAAATT CATATATTTA ATTCAATTAC 780
ATCTAATTTA TTTGAGGGAT ATTGAGTGGT TCTCAGTGAC GTGTGATATT AAGTAAACGG 840
TGGCAGA 847