EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00363 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:14058790-14060444 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:14059938-14059949TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:14059939-14059950TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr1:14059765-14059779ATAAATAATTAATA+6.29
POU4F3MA0791.1chr1:14059765-14059781ATAAATAATTAATAAT+6.2
PROP1MA0715.1chr1:14059939-14059950TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:14059939-14059950TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:14059939-14059950TAATTAAATTA-6.62
RFX1MA0509.2chr1:14059685-14059701CGTTGCTATAGCAACC+6.82
RFX1MA0509.2chr1:14059685-14059701CGTTGCTATAGCAACC-6.82
RFX2MA0600.2chr1:14059685-14059701CGTTGCTATAGCAACC+7.37
RFX2MA0600.2chr1:14059685-14059701CGTTGCTATAGCAACC-7.4
RFX3MA0798.1chr1:14059685-14059701CGTTGCTATAGCAACC+7.17
RFX3MA0798.1chr1:14059685-14059701CGTTGCTATAGCAACC-7.22
RFX4MA0799.1chr1:14059685-14059701CGTTGCTATAGCAACC+6.65
RFX4MA0799.1chr1:14059685-14059701CGTTGCTATAGCAACC-6.67
RFX5MA0510.2chr1:14059685-14059701CGTTGCTATAGCAACC-7.59
RFX5MA0510.2chr1:14059685-14059701CGTTGCTATAGCAACC+7.71
Enhancer Sequence
AGAAAACTGT AAAAGAGCAT TACTGAAACA TCATCATCAC TTCTTCAATA AGCCATTCTG 60
ACCTCTGCGA GAGCGTTTGA GAGCTCTTCT AGATGAGGTG GACGGACGTT CATCTTCTGG 120
TGTTTGCTGG CTGCCGCTCT GCCGCTTCCT CTTCCTGTTA CCCTGATCTG TGGACACAGA 180
TTTGGCCAAC AGGGAAGGCA GAGGTGCGAG AAATCCATCA AGCTCTTGGC TCACGGTCTG 240
GGTTTCACCA TCACCATCAT GTGTCCTGAC GTCCTGAACA GCTGCCTGGA TGAAAGCAGA 300
ACTCCTGGAT CTGGAGCGGC CTGAGACAAC GACAACAACA ACAACATATC ACGTTTATCA 360
TAAGATTATA AGAATTAATC AACAATTAAC TTTAGTAGCT GCATCTACAG AGAATAAAAG 420
ACATCTGATC ACTTATATCG GGGAACAGTT GTGTTGAAAT GGGTTCATTT GTACCAGTTT 480
ATTTACATCA CATTTCCCCA AACATTACAC AACATCATAT CATGATTGAT CATAAACGAA 540
TAAAAACTAA AACACTCACT GCGGTTTTCA CCCATCTGAC AAACTCCTCC AAACTCCAGC 600
AAACCTGAAA ACAAGAACAA AGATCAAATA TCAATAAAAA TGTCAATAAA AACAAGATCA 660
AAATCAAAAT AAACACAACA AAAGAGCAAC AAAACGTGTC AAAAGGAATA ATTTCAGCTC 720
TGAGCGTCGA TCTCCTTGTA AAATAAAAGT CTTCTGTCAG AAATTCTCTG GTCTCCTTGA 780
AGAATCGCAG TATCAGCACA GTAATCCTCA GCAAATGTCT CAGAAATTCG CCTCTCCTCA 840
ATCAACAGAT AGCGGCGAGT CTCGGTGTTT ATATATGGAG TCAAATCATA ACACGCGTTG 900
CTATAGCAAC CACAATTTGA ATCGCCAATC TGAATCACGT GAGTAAACGA TTCATCTCAT 960
CTCAACATAT AAATAATAAA TAATTAATAA TAATAATAAA CATAGTTAAA ATAATAATAA 1020
TTATAATAAT AATAATAATG AAGTTTAAAT CAATTAATTT ATAATTCACG AAACTGTAAT 1080
AATAATGCTA AATGAGCAAG ATTGGTTTGA CAAGGTTTGA CTTTGTAAAA TGTACAGCTA 1140
TTTAGGAATT AATTAAATTA AAATAATAAA ATTAACTCAT ATATTTTCTA TTAGTGGCCC 1200
AAGCAATGTA AGTGCATGCT GTTTAATTAC ACGTACAGTG CTAACTGCTC ACGTAGATAT 1260
TAGGAATATA AGTTAAAAAA AAGTTTATTA TTGTAAATAA TAGAAAGTAA ATTAAATCGT 1320
TCACAATTTC TATGTCTATG CCTGTATTTT ACAGTCTATG GTCTACGCAC GATTTCAGAT 1380
CACATGGCCG TTTGTATCAT CATCTGGTAG GCTACATGGT TCAGTCATAT TTATGTACTT 1440
TTCATTGGCT CTTGTTTTCA GATTTAATAT TATTAAGTTT TAATAATGTT TTCGTTATTT 1500
TTGGATGTAT GTGAAGGCTT TTTAAGGGAC TTTGTGTTCA CTCAACGGCT AGAAAGCACA 1560
AAAGTTCACC TGCCGAATGA GTTCCCGCGT CTGACCACAA GATGGCGTCC ACAGCAGAAA 1620
GGTGCAAGTT TATAAATACA TTATTTCTGT TTGT 1654