EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00360 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:14051485-14053294 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:14052763-14052774TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:14052764-14052775TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr1:14052590-14052604ATAAATAATTAATA+6.29
POU4F3MA0791.1chr1:14052590-14052606ATAAATAATTAATAAT+6.2
PROP1MA0715.1chr1:14052764-14052775TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:14052764-14052775TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:14052764-14052775TAATTAAATTA-6.62
RFX1MA0509.2chr1:14052510-14052526CGTTGCTATAGCAACC+6.82
RFX1MA0509.2chr1:14052510-14052526CGTTGCTATAGCAACC-6.82
RFX2MA0600.2chr1:14052510-14052526CGTTGCTATAGCAACC+7.37
RFX2MA0600.2chr1:14052510-14052526CGTTGCTATAGCAACC-7.4
RFX3MA0798.1chr1:14052510-14052526CGTTGCTATAGCAACC+7.17
RFX3MA0798.1chr1:14052510-14052526CGTTGCTATAGCAACC-7.22
RFX4MA0799.1chr1:14052510-14052526CGTTGCTATAGCAACC+6.65
RFX4MA0799.1chr1:14052510-14052526CGTTGCTATAGCAACC-6.67
RFX5MA0510.2chr1:14052510-14052526CGTTGCTATAGCAACC-7.59
RFX5MA0510.2chr1:14052510-14052526CGTTGCTATAGCAACC+7.71
Enhancer Sequence
CATCAGACCT GCGCATCCCA GCAAACACAG AGCCAAATCC ACCGTCTCCC AGCAGTGGGC 60
CCTTTGCATA CGCGTCTGCA ACACAGAGGA GCAGTAGAAA TGTGTGTTCA AAGAAAACAT 120
GCAGCAGTAG AGAAAACTGT AAAAGAGCAT TACTGAAACA TCATCATCAC TTCTTCAATA 180
AGCCATTCTG ACCTCTGCGA GAGCGTTTGA GAGCTCTTCT AGATGAGGTG GACGGACGTT 240
CATCTTCTGG TGTTTGCTGG CTGCCGCTCT GCCGCTTCCT CTTCCTGTTA CCCTGATCTG 300
TGGACACAGA TTTGGCCAAC AGGGAAGGCA GAGGTGCGAG AAATCCATCA AGCTCTTGGC 360
TCACGGTCTG GGTTTCACCA TCACCATCAT GTGTCCTGAC GTCCTGAACA GCTGCCTGGA 420
TGAAAGCAGA ACTCCTGGAT CTGGAGCGGC CTGAGACAAC GACAACAACA ACAACATATC 480
ACGTTTATCA TAAGATTATA AGAATTAATC AACAATTAAC TTTAGTAGCT GCATCTACAG 540
AGAATAAAAG ACATCTGATC ACTTATATCG GGGAACAGTT GTGTTGAAAT GGGTTCATTT 600
GTACCAGTTT ATTTACATCA CATTTCCCCA AACATTACAC AACATCATAT CATGATTGAT 660
CATAAACAAA TAAAAACTAA AACACTCACT GCGGTTTTCA CCCATCTGAC AAACTCCTCC 720
AAACTCCAGC AAACCTGAAA ACAAGAACAA AGATCAAATA TCAATAAAAA TGTCAATAAA 780
AACAAGATCA AAATCAAAAT AAACACAACA AAAGAGCAAC AAAACGTGTC AAAAGGAATA 840
ATTTCAGCTC TGAGCGTCGA TCTCCTTGTA AAATAAAAGT CTTCTGTCAG AAATTCTCTG 900
GTCTCCTTGA AGAATCGCAG TATCAGCACA GTAATCCTCA GCAAATGTCT CAGAAATTCG 960
CCTCTCCTCA ATCAACAGAT AGCGGCGAGT CTCGGTGTTT ATATATGGAG TCAAATCATA 1020
ACACGCGTTG CTATAGCAAC CACAATTTGA ATCGCCAATC TGAATCATGT GAGTAAACGA 1080
TTCATCTCAT CTCAACATAT AAATAATAAA TAATTAATAA TAATAATAAA CATAGTTAAA 1140
ATAATAATAA TTATAATAAT AATAATAATG AAGTTTAAAT CAATTAATTT ATAATTCACG 1200
AAACTGTAAT AATAATGCTA AATGAGCAAG ATTGGTTTGA CAAGGTTTGA CTTTGTAAAA 1260
TGTACAGCTA TTTAGGAATT AATTAAATTA AAATAATAAA ATTAACTCAT ATATTTTCTA 1320
TTAGTGGCCC AAGCAATGTA AGTGCATGCT GTTTAATTAC ACGTACAGTG CTAACTGCTC 1380
ACGTAGATAT TAGGAATATA AGTTAAAAAA AAGTTTATTA TTGTAAATAA TAGAAAGTAA 1440
ATTAAATCGT TCACAATTTC TATGTCTATG CCTATATTTT ACAGTCTATG GTCTACGCAC 1500
GATTTCAGAT CACATGGCCG TTTGTATCAT CATCTGGTAG GCTACATGGT TCAGTCATAT 1560
TTATGTACTT TTCATTGGCT CTTGTTTTCA GATTTAATAT TATTAAGTTT TAATAATGTT 1620
TTCGTTATTT TTGGATGTAT GTGAAGGCTT TTTAAGGGAC TTTGTGTTCA CTCAACGGCT 1680
AGAAAGCACA AAAGTTCACC TGCCGAATGA GTTCCCGCGT CTGACCACAA GATGGCGTCC 1740
ACAGCAGAAA GGTGCAAGTT TATAAATACA TTATTTCTGT TTGTATGAAT CTAAATAGCT 1800
GTTTTCATC 1809