EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00356 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:14037802-14038898 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:14038449-14038460TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:14038450-14038461TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr1:14038276-14038290ATAAATAATTAATA+6.29
POU4F3MA0791.1chr1:14038276-14038292ATAAATAATTAATAAT+6.2
PROP1MA0715.1chr1:14038450-14038461TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:14038450-14038461TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:14038450-14038461TAATTAAATTA-6.62
RFX1MA0509.2chr1:14038196-14038212CGTTGCTATAGCAACC+6.82
RFX1MA0509.2chr1:14038196-14038212CGTTGCTATAGCAACC-6.82
RFX2MA0600.2chr1:14038196-14038212CGTTGCTATAGCAACC+7.37
RFX2MA0600.2chr1:14038196-14038212CGTTGCTATAGCAACC-7.4
RFX3MA0798.1chr1:14038196-14038212CGTTGCTATAGCAACC+7.17
RFX3MA0798.1chr1:14038196-14038212CGTTGCTATAGCAACC-7.22
RFX4MA0799.1chr1:14038196-14038212CGTTGCTATAGCAACC+6.65
RFX4MA0799.1chr1:14038196-14038212CGTTGCTATAGCAACC-6.67
RFX5MA0510.2chr1:14038196-14038212CGTTGCTATAGCAACC-7.59
RFX5MA0510.2chr1:14038196-14038212CGTTGCTATAGCAACC+7.71
Enhancer Sequence
ACATTACACA ACATCATATC ATGATTGATC ATAAACGAAT AAAAACTAAA ACACTCACTG 60
CGGTTTTCAC CCATCTGACA AACTCCTCCA AACTCCAGCA AACCTGAAAA CAAGAACAAA 120
GATCAAATAT CAATAAAAAT GTCAATAAAA ACAAGATCAA AATCAAAATA AACACAACAA 180
AAGAGCAACA AAACGTGTCA AAAGGAATAA TTTCAGCTCT GAGCGTCGAT CTCCTTGTAA 240
AATAAAAGTC TTCTGTCAGA AATTCTCTGG TCTCCTTGAA GAATCGCAGT ATCAGCACAG 300
TAATCCTCAG CAAATGTCTC AGAAATTCGC CTCTCCTCAA TCAACAGATA GCGGCGAGTC 360
TCGGTGTTTA TATATGGAGT CAAATCATAA CACGCGTTGC TATAGCAACC ACAATTTGAA 420
TCGCCAATCT GAATCACGTG AGTAAACGAT TCATCTCATC TCAACATATA AATAATAAAT 480
AATTAATAAT AATAATAAAC ATAGTTAAAA TAATAATAAT TATAATAATA ATAATAATGA 540
AGTTTAAATC AATTAATTTA TAATTCACGA AACTGTAATA ATAATGCTAA ATGAGCAAGA 600
TTGGTTTGAC AAGGTTTGAC TTTGTAAAAT GTACAGCTAT TTAGGAATTA ATTAAATTAA 660
AATAATAAAA TTAACTCATA TATTTTCTAT TAGTGGCCCA AGCAATGTAA GTGCATGCTG 720
TTTAATTACA CGTACAGTGC TAACTGCTCA CGTAGATATT AGGAATATAA GTTAAAAAAA 780
AGTTTATTAT TGTAAATAAT AGAAAGTAAA TTAAATCGTT CACAATTTCT ATGTCTATGC 840
CTGTATTTTA CAGTCTATGG TCTACGCACG ATTTCAGATC ACATGGCCGT TTGTATCATC 900
ATCTGGTAGG CTACATGGTT CAGTCATATT TATGTACTTT TCATTGGCTC TTGTTTTCAG 960
ATTTAATATT ATTAAGTTTT AATAATGTTT TCGTTATTTT TGGATGTATG TGAAGGCTTT 1020
TTAAGGGACT TTGTGTTCAC TCAACGGCTA GAAAGCACAA AAGTTCACCT GCCGAATGAG 1080
TTCCCGCGTC TGACCA 1096