EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00354 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:14030165-14031637 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:14031309-14031320TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:14031310-14031321TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr1:14031136-14031150ATAAATAATTAATA+6.29
POU4F3MA0791.1chr1:14031136-14031152ATAAATAATTAATAAT+6.2
PROP1MA0715.1chr1:14031310-14031321TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:14031310-14031321TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:14031310-14031321TAATTAAATTA-6.62
RFX1MA0509.2chr1:14031056-14031072CGTTGCTATAGCAACC+6.82
RFX1MA0509.2chr1:14031056-14031072CGTTGCTATAGCAACC-6.82
RFX2MA0600.2chr1:14031056-14031072CGTTGCTATAGCAACC+7.37
RFX2MA0600.2chr1:14031056-14031072CGTTGCTATAGCAACC-7.4
RFX3MA0798.1chr1:14031056-14031072CGTTGCTATAGCAACC+7.17
RFX3MA0798.1chr1:14031056-14031072CGTTGCTATAGCAACC-7.22
RFX4MA0799.1chr1:14031056-14031072CGTTGCTATAGCAACC+6.65
RFX4MA0799.1chr1:14031056-14031072CGTTGCTATAGCAACC-6.67
RFX5MA0510.2chr1:14031056-14031072CGTTGCTATAGCAACC-7.59
RFX5MA0510.2chr1:14031056-14031072CGTTGCTATAGCAACC+7.71
Enhancer Sequence
AACTGTAAAA GAGCATTACT GAAACATCAT CATCACTTCT TCAATAAGCC ATTCTGACCT 60
CTGCGAGAGC GTTTGAGAGC TCTTCTAGAT GAGGTGGACG GACGTTCATC TTCTGGTGTT 120
TGCTGGCTGC CGCTCTGCCG CTTCCTCTTC CTGTTACCCT GATCTGTGGA CACAGATTTG 180
GCCAACAGGG AAGGCAGAGG TGCGAGAAAT CCATCAAGCT CTTGGCTCAC GGTCTGGGTT 240
TCACCATCAC CATCATGTGT CCTGACGTCC TGAACAGCTG CCTGGATGAA AGCAGAACTC 300
CTGGATCTGG AGCGGCCTGA GACAACGACA ACAACAACAA CATATCACGT TTATCATAAG 360
ATTATAAGAA TTAATCAACA ATTAACTTTA GTAGCTGCAT CTACAGAGAA TAAAAGACAT 420
CTGATCACTT ATATCGGGGA ACAGTTGTGT TGAAATGGGT TCATTTGTAC CAGTTTATTT 480
ACATCACATT TCCCCAAACA TTACACAACA TCATATCATG ATTGATCATA AACGAATAAA 540
AACTAAAACA CTCACTGCGG TTTTCACCCA TCTGACAAAC TCCTCCAAAC TCCAGCAAAC 600
CTGAAAACAA GAACAAAGAT CAAATATCAA TAAAAATGTC AATAAAAACA AGATCAAAAT 660
CAAAATAAAC ACAACAAAAG AGCAACAAAA CGTGTCAAAA GGAATAATTT CAGCTCTGAG 720
CGTCGATCTC CTTGTAAAAT AAAAGTCTTC TGTCAGAAAT TCTCTGGTCT CCTTGAAGAA 780
TCGCAGTATC AGCACAGTAA TCCTCAGCAA ATGTCTCAGA AATTCGCCTC TCCTCAATCA 840
ACAGATAGCG GCGAGTCTCG GTGTTTATAT ATGGAGTCAA ATCATAACAC GCGTTGCTAT 900
AGCAACCACA ATTTGAATCG CCAATCTGAA TCACGTGAGT AAACGATTCA TCTCATCTCA 960
ACATATAAAT AATAAATAAT TAATAATAAT AATAAACATA GTTAAAATAA TAATAATTAT 1020
AATAATAATA ATAATGAAGT TTAAATCAAT TAATTTATAA TTCACGAAAC TGTAATAATA 1080
ATGCTAAATG AGCAAGATTG GTTTGACAAG GTTTGACTTT GTAAAATGTA CAGCTATTTA 1140
GGAATTAATT AAATTAAAAT AATAAAATTA ACTCATATAT TTTCTATTAG TGGCCCAAGC 1200
AATGTAAGTG CATGCTGTTT AATTACACGT ACAGTGCTAA CTGCTCACGT AGATATTAGG 1260
AATATAAGTT AAAAAAAAGT TTATTATTGT AAATAATAGA AAGTAAATTA AATCGTTCAC 1320
AATTTCTATG TCTATGCCTG TATTTTACAG TCTATGGTCT ACGCACGATT TCAGATCACA 1380
TGGCCGTTTG TATCATCATC TGGTAGGCTA CATGGTTCAG TCATATTTAT GTACTTTTCA 1440
TTGGCTCTTG TTTTCAGATT TAATATTATT AA 1472