EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00352 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:14023083-14024375 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:14024169-14024180TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:14024170-14024181TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr1:14023996-14024010ATAAATAATTAATA+6.29
POU4F3MA0791.1chr1:14023996-14024012ATAAATAATTAATAAT+6.2
PROP1MA0715.1chr1:14024170-14024181TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:14024170-14024181TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:14024170-14024181TAATTAAATTA-6.62
RFX1MA0509.2chr1:14023916-14023932CGTTGCTATAGCAACC+6.82
RFX1MA0509.2chr1:14023916-14023932CGTTGCTATAGCAACC-6.82
RFX2MA0600.2chr1:14023916-14023932CGTTGCTATAGCAACC+7.37
RFX2MA0600.2chr1:14023916-14023932CGTTGCTATAGCAACC-7.4
RFX3MA0798.1chr1:14023916-14023932CGTTGCTATAGCAACC+7.17
RFX3MA0798.1chr1:14023916-14023932CGTTGCTATAGCAACC-7.22
RFX4MA0799.1chr1:14023916-14023932CGTTGCTATAGCAACC+6.65
RFX4MA0799.1chr1:14023916-14023932CGTTGCTATAGCAACC-6.67
RFX5MA0510.2chr1:14023916-14023932CGTTGCTATAGCAACC-7.59
RFX5MA0510.2chr1:14023916-14023932CGTTGCTATAGCAACC+7.71
Enhancer Sequence
CTCTGCGAGA GCGTTTGAGA GCTCTTCTAG ATGAGGTGGA CGGACGTTCA TCTTCTGGTG 60
TTTGCTGGCT GCCGCTCTGC CGCTTCCTCT TCCTGTTACC CTGATCTGTG GACACAGATT 120
TGGCCAACAG GGAAGGCAGA GGTGCGAGAA ATCCATCAAG CTCTTGGCTC ACGGTCTGGG 180
TTTCACCATC ACCATCATGT GTCCTGACGT CCTGAACAGC TGCCTGGATG AAAGCAGAAC 240
TCCTGGATCT GGAGCGGCCT GAGACAACGA CAACAACAAC AACATATCAC GTTTATCATA 300
AGATTATAAG AATTAATCAA CAATTAACTT TAGTAGCTGC ATCTACAGAG AATAAAAGAC 360
ATCTGATCAC TTATATCGGG GAACAGTTGT GTTGAAATGG GTTCATTTGT ACCAGTTTAT 420
TTACATCACA TTTCCCCAAA CATTACACAA CATCATATCA TGATTGATCA TAAACGAATA 480
AAAACTAAAA CACTCACTGC GGTTTTCACC CATCTGACAA ACTCCTCCAA ACTCCAGCAA 540
ACCTGAAAAC AAGAACAAAG ATCAAATATC AATAAAAATG TCAATAAAAA CAAGATCAAA 600
ATCAAAATAA ACACAACAAA AGAGCAACAA AACGTGTCAA AAGGAATAAT TTCAGCTCTG 660
AGCGTCGATC TCCTTGTAAA ATAAAAGTCT TCTGTCAGAA ATTCTCTGGT CTCCTTGAAG 720
AATCGCAGTA TCAGCACAGT AATCCTCAGC AAATGTCTCA GAAATTCGCC TCTCCTCAAT 780
CAACAGATAG CGGCGAGTCT CGGTGTTTAT ATATGGAGTC AAATCATAAC ACGCGTTGCT 840
ATAGCAACCA CAATTTGAAT CGCCAATCTG AATCACGTGA GTAAACGATT CATCTCATCT 900
CAACATATAA ATAATAAATA ATTAATAATA ATAATAAACA TAGTTAAAAT AATAATAATT 960
ATAATAATAA TAATAATGAA GTTTAAATCA ATTAATTTAT AATTCACGAA ACTGTAATAA 1020
TAATGCTAAA TGAGCAAGAT TGGTTTGACA AGGTTTGACT TTGTAAAATG TACAGCTATT 1080
TAGGAATTAA TTAAATTAAA ATAATAAAAT TAACTCATAT ATTTTCTATT AGTGGCCCAA 1140
GCAATGTAAG TGCATGCTGT TTAATTACAC GTACAGTGCT AACTGCTCAC GTAGATATTA 1200
GGAATATAAG TTAAAAAAAA GTTTATTATT GTAAATAATA GAAAGTAAAT TAAATCGTTC 1260
ACAATTTCTA TGTCTATGCC TGTATTTTAC AG 1292