EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00349 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:14016114-14017089 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:14017029-14017040TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:14017030-14017041TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr1:14016856-14016870ATAAATAATTAATA+6.29
POU4F3MA0791.1chr1:14016856-14016872ATAAATAATTAATAAT+6.2
PROP1MA0715.1chr1:14017030-14017041TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:14017030-14017041TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:14017030-14017041TAATTAAATTA-6.62
RFX1MA0509.2chr1:14016776-14016792CGTTGCTATAGCAACC+6.82
RFX1MA0509.2chr1:14016776-14016792CGTTGCTATAGCAACC-6.82
RFX2MA0600.2chr1:14016776-14016792CGTTGCTATAGCAACC+7.37
RFX2MA0600.2chr1:14016776-14016792CGTTGCTATAGCAACC-7.4
RFX3MA0798.1chr1:14016776-14016792CGTTGCTATAGCAACC+7.17
RFX3MA0798.1chr1:14016776-14016792CGTTGCTATAGCAACC-7.22
RFX4MA0799.1chr1:14016776-14016792CGTTGCTATAGCAACC+6.65
RFX4MA0799.1chr1:14016776-14016792CGTTGCTATAGCAACC-6.67
RFX5MA0510.2chr1:14016776-14016792CGTTGCTATAGCAACC-7.59
RFX5MA0510.2chr1:14016776-14016792CGTTGCTATAGCAACC+7.71
Enhancer Sequence
CGGTCTGGGT TTCACCATCA CCATCATGTG TCCTGACGTC CTGAACAGCT GCCTGGATGA 60
AAGCAGAACT CCTGGATCTG GAGCGGCCTG AGACAACGAC AACAACAACA ACATATCACG 120
TTTATCATAA GATTATAAGA ATTAATCAAC AATTAACTTT AGTAGCTGCA TCTACAGAGA 180
ATAAAAGACA TCTGATCACT TATATCGGGG AACAGTTGTG TTGAAATGGG TTCATTTGTA 240
CCAGTTTATT TACATCACAT TTCCCCAAAC ATTACACAAC ATCATATCAT GATTGATCAT 300
AAACGAATAA AAACTAAAAC ACTCACTGCG GTTTTCACCC ATCTGACAAA CTCCTCCAAA 360
CTCCAGCAAA CCTGAAAACA AGAACAAAGA TCAAATATCA ATAAAAATGT CAATAAAAAC 420
AAGATCAAAA TCAAAATAAA CACAACAAAA GAGCAACAAA ACGTGTCAAA AGGAATAATT 480
TCAGCTCTGA GCGTCGATCT CCTTGTAAAA TAAAAGTCTT CTGTCAGAAA TTCTCTGGTC 540
TCCTTGAAGA ATCGCAGTAT CAGCACAGTA ATCCTCAGCA AATGTCTCAG AAATTCGCCT 600
CTCCTCAATC AACAGATAGC GGCGAGTCTC GGTGTTTATA TATGGAGTCA AATCATAACA 660
CGCGTTGCTA TAGCAACCAC AATTTGAATC GCCAATCTGA ATCACGTGAG TAAACGATTC 720
ATCTCATCTC AACATATAAA TAATAAATAA TTAATAATAA TAATAAACAT AGTTAAAATA 780
ATAATAATTA TAATAATAAT AATAATGAAG TTTAAATCAA TTAATTTATA ATTCACGAAA 840
CTGTAATAAT AATGCTAAAT GAGCAAGATT GGTTTGACAA GGTTTGACTT TGTAAAATGT 900
ACAGCTATTT AGGAATTAAT TAAATTAAAA TAATAAAATT AACTCATATA TTTTCTATTA 960
GTGGCCCAAG CAATG 975