EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00339 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:13960660-13962431 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:13960762-13960773AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:13960761-13960772TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr1:13960932-13960946TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr1:13960930-13960946ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr1:13960761-13960772TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:13960761-13960772TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:13960761-13960772TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr1:13961010-13961026GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr1:13961010-13961026GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr1:13961010-13961026GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr1:13961010-13961026GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr1:13961010-13961026GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr1:13961010-13961026GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr1:13961010-13961026GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr1:13961010-13961026GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr1:13961010-13961026GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr1:13961010-13961026GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
AATATCTACG TGAGCAGTTA GCACTGTACG TGTAATTAAA CAGCATGCAC TTACATTGCT 60
TGGGCCACTA ATAGAAAATA TATGAGTTAA TTTTATTATT TTAATTTAAT TAATTCCTAA 120
ATAGCTGTAC ATTTTACAAA GTCAAACCTT GTCAAACCAA TCTTGCTCAT TTAGCATTAT 180
TATTACAGTT TCGTGAATTA TAAATTAATT GATTTAAACT TCATTATTAT TATTATTATA 240
ATTATTATTA TTTTAACTAT GTTTATTATT ATTATTAATT ATTTATTATT TATATGTTGA 300
GATGAGATGA ATCGTTTACT CACGTGATTC AGATTGGCGA TTCAAATTGT GGTTGCTATA 360
GCAACGCGTG TTATGATTTG ACTCCATATA TAAACACCGA GACTCGCCGC TATCTGTTGA 420
TTGAGGAGAG GCGAATTTCT GAGACATTTG CTGAGGATTA CTGTGCTGAT ACTGCGATTC 480
TTCAAGGAGA CCAGAGAATT TCTGACAGAA GACTTTTATT TTACAAGGAG ATCGACGCTC 540
AGAGCTGAAA TTATTCCTTT TGACACGTTT TGTTGCTCTT TTGTTGTGTT TATTTTGATT 600
TTGATCTTGT TTTTATTGAC ATTTTTATTG ATATTTGATC TTTGTTCTTG TTTTCAGGTT 660
TGCTGGAGTT TGGAGGAGTT TGTCAGATGG GTGAAAACCG CAGTGAGTGT TTTAGTTTTT 720
ATTCGTTTAT GATCAATCAT GATATGATGT TGTGTAATGT TTGGGGAAAT GTGATGTAAA 780
TAAACTGGTA CAAATGAACC CATTTCAACA CAACTGTTCC CCGATATAAG TGATCAGATG 840
TCTTTTATTC TCTGTAGATG CAGCTACTAA AGTTAATTGT TGATTAATTC TTATAATCTT 900
ATGATAAACG TGATATGTTG TTGTTGTTGT CGTTGTCTCA GGCCGCTCCA GATCCAGGAG 960
TTCTGCTTTC ATCCAGGCAG CTGTTCAGGA CGTCAGGACA CATGATGGTG ATGGTGAAAC 1020
CCAGACCGTG AGCCAAGAGC TTGATGGATT TCTCGCACCT CTGCCTTCCC TGTTGGCCAA 1080
ATCTGTGTCC ACAGATCAGG GTAACAGGAA GAGGAAGCGG CAGAGCGGCA GCCAGCAAAC 1140
ACCAGAAGAT GAACGTCCGT CCACCTCATC TAGAAGAGCT CTCAAACGCT CTCGCAGAGG 1200
TCAGAATGGC TTATTGAAGA AGTGATGATG ATGTTTCAGT AATGCTCTTT TACAGTTTTC 1260
TCTACTGCTG CATGTTTTCT TTGAACACAC ATTTCTACTG CTCCTCTGTG TTGCAGACGC 1320
GTATGCAAAG GGCCCACTGC TGGGAGACGG TGGATTTGGC TCTGTGTTTG CTGGGATGCG 1380
CAGGTCTGAT GGACTGCCAG TAAGTCGTTT TCTCCGCTCT TCATTCAAAC AGCCTTTAGA 1440
AATCCTGATC TCAGTAAATG TGATGTGTGA GGATCAGGCA GGTGTGATTT ATTATGCTTT 1500
ATCTGTCTAC AGGTCGCCAT CAAGTATGTG TCTAAAGAGC GGACACAGAG GAGACTGAGA 1560
GTTGTGAGTT CAGTGTGAAC CTGTTGTTGT GTTTGATGTT TCATTGGGTT CTGAATCCAA 1620
TCGTTTGTCC TGCAGGAAGG TCAGGGTCGG CTGCCGCTGG AGGTGGCACT GATGACCCGC 1680
GTCAATTCAG CTCCTGCCTG CCCCAACGTC CTGCAGCTGC TAGACTGGTT TGACCGTCCC 1740
AGACGCTACA TCCTGATCCT GGAGCGTCCG G 1771