EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00332 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:13936948-13938922 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:13937459-13937470AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:13937458-13937469TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr1:13937656-13937670TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr1:13937654-13937670ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr1:13937458-13937469TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:13937458-13937469TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:13937458-13937469TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr1:13937734-13937750GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr1:13937734-13937750GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr1:13937734-13937750GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr1:13937734-13937750GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr1:13937734-13937750GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr1:13937734-13937750GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr1:13937734-13937750GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr1:13937734-13937750GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr1:13937734-13937750GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr1:13937734-13937750GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
AGCTATTTAG ATTCATACAA ACAGAAATAA TGTATTTATA AACTTGCACC TTTCTGCTGT 60
GGACGCCATC TTGTGGTCAG ACACGGGAAC TCATTCGGCA GGTGAACTTT TGTGCTTTCT 120
AGCCGTTGAG TGAACACAAA GTCCCTTAAA AAGCCTTCAC ATACATCCAA AATAACGAAA 180
ACATTAATAA AACTTAATAA TATTAAATCT GAAAACAAGA GCAAATGAAA AGTACATAAA 240
TATGACTGAA CCATGTAGCC TACCAGATGA TGATACAAAC GGCCATGTGA TCTGAAATCG 300
TGCGTAGACC ATAGACTGTA AAATATAGGC ATAGACATAG AAATTGTGAA CGATTTAATT 360
TACTTTCTAT TATTTACAAT AATAAACTTT TTTTAAAACT TATATTCCTA ATATCTACGT 420
GAGCAGTTAG CACTGTACGT GTAATTAAAC AGCATGCACT TACATTGCTT GGGCCACTAA 480
TAGAAAATAT ATGAGTTAAT TTTATTATTT TAATTTAATT AATTCCTAAA TAGCTGTACA 540
TTTTACAAAG TCAAACCTTG TCAAACCAAT CTTGCTCATT TAGCATTATT ATTACAGTTT 600
CGTGAATTAT AAATTAATTG ATTTAAACTT CATTATTATT ATTATTATTA TTATTATTAT 660
TATTATTATT ATTACTATTA TTATTATTAT AACTATGTTA TTTATTATTA TTAATTATTT 720
ATTATTTATA TGTTGAGATG AGATGAATCG TTTACTCACG TGATTCAGAT TGGCGATTCA 780
AATTGTGGTT GCTATAGCAA CGCGTGTTAT GATTTGACTC CATATATAAA CACCTAGACT 840
CGCCGCTATC TGTTGATTGA GGAGAGGCGA ATTTCTGAGA CATTTGCTGA GGATTACTGT 900
GCTGATACTG CGATTCTTCA AGGAGACCAG AGAATTTCTG ACAGAAGACT TTTATTTTAC 960
AAGGAGATCG ACGCTCAGAG CTGAAATTAT TCCTTTTGAC ACGTTTTGTT GCTCTTTTGT 1020
TGTGTTTATT TTGATTTTGA TCTTGTTTTT ATTGTTTTTA TTGACATTTT TATTGATATT 1080
TGATCTTTGT TCTTGTTTTC AGGTTTGCTG GAGTTTGGAG GAGTTTGTCA GATGGGTGAA 1140
AACCGCAGTG AGTGTTTTAG TTTTTATTTG TTTATGATCA ATCATGATAT GATGTTGTGT 1200
AATGTTTGGG GAAATGTGAT GTAAATAAAC TGGTACAAAT GAACCCATTT CAACACAACT 1260
GTTCCCCGAT ATAAGTGATC AGATGTCTTT TATTCTCTGT AGATGCAGCT ACTAAAGTTA 1320
ATTGTTGATT AATTCTTATA ATCTTATGAT AAACGTGATA TGTTGTTGTT GTTGTCGTTG 1380
TCTCAGGCCG CTCCAGATCC AGGAGTTCTG CTTTCATCCA GGCAGCTGTT CAGGACGTCA 1440
GGACACATGA TGGTGATGGT GAAACCCAGA CCGTGAGCCA AGAGCTTGAT GGATTTCTCG 1500
CACCTCTGCC TTCCCCGTTG GCCAAATCTG TGTCCACAGA TCAGGGTAAC AGGAAGAGGA 1560
AGCGGCAGAG CGGCAGCCAG CAAACACCAG AAGATGAACG TCCGTCCACC TCATCTAGAA 1620
GAGCTCTCAA ACGCTCTCGC AGAGGTCAGA ATGGCTTATT GAAGAAGTGA TGATGATGTT 1680
TCAGTAATGC TCTTTTACAG TTTTCTCTAC TGCTGCATGT TTTCTTTGAA CACACATTTC 1740
TACTGCTCCT CTGTGTTGCA GACGCGTATG CAAAGGGCCC ACTGCTGGGA GACGGTGGAT 1800
TTGGCTCTGT GTTTGCTGGG ATGCGCAGGT CTGATGGACT GCCAGTAAGT CGTTTTCTCC 1860
GCTCTTCATT CAAACAGCCT TTAGAAATCC TGATCTCAGT AAATGTGATG TGTGAGGATC 1920
AGGCAGGTGT GATTTATTAT GCTTTATCTG TCTACAGGTC GCCATCAAGT ATGT 1974