EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00329 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:13904944-13907063 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr1:13905541-13905558ATAAATTAATTAATTTA+6.07
LMX1BMA0703.2chr1:13905444-13905455AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr1:13905543-13905556AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr1:13905544-13905557AATTAATTAATTT-6.92
PHOX2AMA0713.1chr1:13905443-13905454TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr1:13905623-13905637TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr1:13905621-13905637ATTATTAATTATTTAT-6.2
POU6F1MA0628.1chr1:13905545-13905555ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:13905545-13905555ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr1:13905443-13905454TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:13905443-13905454TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:13905443-13905454TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
ATTCATACAA ACAGAAATAA TGTATTTATA AACTTGCACC TTTCTGCTGT GGACGCTATC 60
TTGTGGTCAG ACGCGGGAAC TCATTCGGCA GGTGAACTTT TGTGCTTTCT AGCCCTTGAG 120
TGAACACAAA GTCCCTTAAA AAGCCTTCAC ATACATCCAA AAATAACGAA AACATTAATA 180
AAACTTAATA ATATTAAATC TGAAAACAAG AGCAAATGAA AAGTACATAA ATATGACTGA 240
ACCATGTAGC CTACCAGATG ATGATACAAA CGGCCATGTG ATCTGAAATC GTGCGTAGAC 300
CATAGACTGT AAAATATAGG CATAGACATA GAAATTGTGA ACGATTTAAT TTACTTTCTA 360
TTATTTACAA TAATAAACTT TTTTTAACTT ATATTCCTAA TATCTACGTG AGCAGTTAGC 420
ACTGTACGTG TAATTAACCA GCATGCACTT ACATTGCTTG GGCCACAAAT AGAAAATATA 480
TGAGTTAATT TTATTATTTT AATTTAATTA ATTCCTAAAT AGCTGTACAT TTTACAAAGT 540
CAAACCTTGT CAAACCAATC TTGCTCATTT AGCATTATTA TTACAGTTTC GTGAATTATA 600
AATTAATTAA TTTAAACTTC ATTATTATTA TCATTATTAT TACTATTATT ATTATTATTA 660
TAACTATGTT ATTTATTATT ATTAATTATT TATTATTTAT ATGTTGAGAT GAGATGAATC 720
GTTTACTCAC GTGATTCAGA TTGGCGATTC AAATTGCGGT GGCTATAGCA ACGCGTGTTA 780
TGATTTGACT CCATATATAA ACACCGAGAC TCGCCGCTAT CTGTTGATTG AGGAGAGGCG 840
AATTTCTGAG ACATTTGCTG AGGATTACTG TGCTGATACT GCGATTCTTC AAGGAGACCA 900
GAGAATTTCT GACAGAAGAC TTTTATTTTA CAAGGAGATC GACGCTCAGA GCTGAAATTA 960
TTCCTTTTGA CACGTTTTGT TGCTCTTTTG TTGTGTTTAT TTTGATTTTG ATCTTGTTTT 1020
TATTGTTTTT ATTGACATTT TTATTGATAT TTGATCTTTG TTCTTGTTTT CAGGTTTGCT 1080
GGAGTTTGGA GGAGTTTGTC AGATGGGTGA AAACCGCAGT GAGTGTTTTA GTTTTTATTT 1140
GTTTATGATC AATCATGATA TGATGTTGTG TAATGTTTGG GGAAATGTGA TGTAAATAAA 1200
CTGGTACAAA TGAACCCATT TCAACACAAC TGTTCCCCGA TATAAGTGAT CAGATGTCTT 1260
TTATTCTCTG TTGATGCAGC TACTAAAGTT AATTGTTGAT TAATTCTTAT AATCTTATGA 1320
TAAACGTGAT ATGTTGTTGT TGTTGTTGTC GTTGTCTCAG GCCGCTCCAG ATCCAGAAGT 1380
TCTGCTTTCA TCCAGGCAGC TGTTCAGGAC GTCAGGACAC ATGATGGTGA TGGTGAAACC 1440
CAGACCGTGA GCCAAGAGCT TGATGGATTT CTCGCACCTC TGCCTTCCCC GTTGGCCAAA 1500
TCTGTGTCCA CAGATCAGGG TAACAGGAAG AGGAAGCGGC AGAGCGGCAG CCAGCAAACA 1560
CCAGAAGATG AACGTCCGTC CACCTCATCT AGAAGAGCTC TCAAACGCTC TCGCAGAGGT 1620
CAGAATGGCT TATTGAAGAA GTGATGATGA TGTTTCAGTA ATGCTCTTTT ACAGTTTTCT 1680
CTACTGCTGC ATGTTTTCTT TGAACACACA TTTCTACTGC TCTTCTGTGT TGCAGACGCG 1740
TATGCAAAGG GCCCACTGCT GGGAGACGGT GGATTTGGCT CTGTGTTTGC TGGGATGCGC 1800
AGGTCTGATG GACTGCCAGT AAGTCGTTTT CTCCGCTCTT CATTCAAACA GCCTTTAGAA 1860
ATCCTGATCT CAGTAAATGT GATGTGTGAG GATCAGGCAG GTGTGATTTA TTATGCTTTA 1920
TCTGTCTACA GGTCGCCATC AAGTATGTGT CTAAAGAGCG GACACAGAGG AGACTGAGAG 1980
TTGTGAGTTC AGTGTGAACC TGTTGTTGTG TTTGATGTTT CATTGGGTTC TGAATCCAAT 2040
CGTTTGTCCT GCAGGAAGGT CAGGGTCGGC TGCCGCTGGA GGTGGCACTG ATGACCCGCG 2100
TCAATTCAGC TCCTGCCTG 2119