EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00324 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:13888008-13889174 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr1:13888030-13888046GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr1:13888030-13888046GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr1:13888030-13888046GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr1:13888030-13888046GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr1:13888030-13888046GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr1:13888030-13888046GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr1:13888030-13888046GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr1:13888030-13888046GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr1:13888030-13888046GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr1:13888030-13888046GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
TCAGAATAGC GATTCAAATT GTGGTTGCTA TAGCAACGCG TGTTATGATT TGACTCCATA 60
TATAAACACC GAGACTCGCC GCTATCTGTT GATTGAGGAG AGGCGAATTT CTGAGACATT 120
TGCTGAGGAT TACTGTGCTG ATACTGCGAT TCTTCAAGGA GACCAGAGAA TTTCTGACAG 180
AAGACTTTTA TTTTACAAGG AGATCGACGC TCAGAGCTGA AATTATTCCT TTTGACACGT 240
TTTGTTGCTC TTTTGTTGTG TTTATTTTGA TTTTGATCTT GTTTTTATTG ACATTTTTAT 300
TGATATTTGA TCTTTGTTTT TGTTTTCAGG TTTGCTGGAG TTTGGAGGAG TTTGTCAGAT 360
GGGTGAAAAC CGCAGTGAGT GTTTTAGTTT TTATTTGTTT ATGATCAATC ATGATATGAT 420
GTTGTGTAAT GTTTGGGGAA ATGTGATGTA AATAAACTGG TACAAATGAA CCCATTTCAA 480
CACAACTGTT CCCCGATATA AGTGATCAGA TGTCTTTTAT TCTCTGTAGA TGCAGCTACT 540
AAAGTTAATT GTTGATTAAT TCTTATAATC TTATGATAAA CGTGATATGT TGTTGTTGTT 600
GTCGTTGTCT CAGGCCGCTC CAGATCCAGG AGTTCTGCTT TCATCCAGGC AGCTGTTCAG 660
GACGTCAGGA CACATGATGG TGATGGTGAA ACCCAGACCG TGAGCCAAGA GCTTGATGGA 720
TTTCTCGCAC CTCTGCCTTC CCCGTTGGCC AAATCTGTGT CCACAGATCA GGGTAACAGG 780
AAGAGGAAGC GGCAGAGCGG CAGCCAGCAA ACACCAGAAG ATGAACGTCC GTCCACCTCA 840
TCTAGAAGAG CTCTCAAACG CTCTCGCAGA GGTCAGAATG GCTTATTGAA GAAGTGATGA 900
TGATGTTTCA GTAATGCTCT TTTACAGTTT TCTCTACTGC TGCATGTTTT CTTTGAACAC 960
ACATTTCTAC TGCTCCTCTG TGTTGCAGAC GCGTATGCAA AGGGCCCACT GCTGGGAGAC 1020
GGTGGATTTG GCTCTGTGTT TGCTGGGATG CGCAGGTCTG ATGGACTGCC AGTAAGTCGT 1080
TTTCTCCGCT CTTCATTCAA ACAGCCTTTA GAAATCCTGA TCTCAGTAAA TGTGATGTGT 1140
GAGGATCAGG CAGGTGTGAT TTATTA 1166