EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00322 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:13877285-13878357 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxo1MA0480.1chr1:13877967-13877978TGCTGTTTACA+6.14
HES6MA1493.1chr1:13877993-13878003GGCACGTGTT+6.02
RESTMA0138.2chr1:13877686-13877707GGAGCTGTCCATTGTGCTGAA-9.64
Enhancer Sequence
AGGCTTTCTT TAGTCTTGTG TATTGATTAA TGTGCGCGAG GGCAACTATT GGTTTAATGA 60
GGGAGTTTTC TGAGAGATGA AGAGCTGTAA AGTGAGTGTT CAATTACAAA AAGAAATGAT 120
TATACAAACT CAGTGTTTCC TTTTATTAAC ATTGACAAAA CCGTATTACT TTAAAAGAAA 180
TATGATTATC AAAGCATGTC TTAGAGCGAA TAAGCCCAAC AGGATTTTTA TATAATCGCC 240
TTTTACCTTA ATTTATATAT AAAATAAATG TTTAATTAGT AATCACTACT GATGGGTTAG 300
ATTTTCAATA TTCAATATTG TTCAGTAATT ATTCAGCAGT AATTAAACAT CTCTGTAGCA 360
TTTCCTCCTG CAGATGTGGT TCAGTCAGTT CAGCACTGCA GGGAGCTGTC CATTGTGCTG 420
AATTTACTCC ACACTAAACT CTCTTCTCAC ATTAAATTCA TTATAAGTGT CTGATCAGTG 480
AACAGGATAC TGTCATTTCT CAACAACTAA AGAAGGTCTA ATGTAGAAAT TAAAAGATAA 540
TAGGAAATAC AAACAGATGG ATTTGCTTTA TGAAAGGAAA TTTTGTTGAA TGATTATTAC 600
AATTTGGTTT AAATGTTGAA TGTTGCACTC GTATATGTTG CATTGCTCTG CTCTTCTTTA 660
AATAAATCAA ACCTCAGTTG TGTGCTGTTT ACACTGTCTC TGATTCATGG CACGTGTTTT 720
AATAAATCAG ACTTTTGCAT CTTCAGTTTC TCATCAATTC CAAGTCATGA AAATAATAAA 780
AGCAACATTT ACAGCTGCAG CGTGCACTAA ATATTTTCTT ACTTTTCTTA TTTCTGTTTT 840
TGTCTAACCA CAGTTTATCT CATGCATTGA TGTGTGTATT GAGCATGCAA GATCACCAGC 900
TTGACCACAA ACAGTTTTAG GACATTCAGT CTGTTGCATG CCTGAATAAA AACACTTGTG 960
GTTTGTGTTC TCGCCTAGCT TTTCACAGCA ACTGCAACAT CACTGCACCA GGAGCGTCAG 1020
TAAAGACCAA GAAGAAGAAG AAGAAACACA GCACTGAGCC TGAAAGCTGA TG 1072