EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00321 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:13870664-13873114 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr1:13871341-13871353TATGTTTACTTT-6.11
Foxo1MA0480.1chr1:13870794-13870805TGCTGTTTACA+6.14
HES6MA1493.1chr1:13870820-13870830GGCACGTGTT+6.02
LMX1BMA0703.2chr1:13872154-13872165AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr1:13872155-13872168ATTTAATTAATTT-6.07
PHOX2AMA0713.1chr1:13872153-13872164TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr1:13872324-13872338TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr1:13872322-13872338ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr1:13872153-13872164TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:13872153-13872164TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:13872153-13872164TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr1:13872402-13872418GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr1:13872402-13872418GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr1:13872402-13872418GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr1:13872402-13872418GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr1:13872402-13872418GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr1:13872402-13872418GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr1:13872402-13872418GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr1:13872402-13872418GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr1:13872402-13872418GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr1:13872402-13872418GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
ACAGATGGAT TTGCTTTATG AAAGGAAATT TTGTTGAATG ATTATTACAA TTTGGTTTAA 60
ATGTTGAATG TTGCACTCGT ATATGTTGCA TTGCTCTGCT CTTCTTTAAA TAAATCAAAC 120
CTCAGTTGTG TGCTGTTTAC ACTGTCTCTG ATTCATGGCA CGTGTTTTAA TAAATCAGAC 180
TTTTGCATCT TCAGTTTCTC ATCAATTCCA AGTCATGAAA ATAATAAAAG CAACATTTAC 240
AGCTGCAGCG TGCACTAAAT ATTTTCTTAC TTTTCTTATT TCTGTTTTTG TCTAACCACA 300
GTTTATCTCA TGCATTGATG TGTGTATTGA GCATGCAAGA TCACCAGCTT GACCACAAAC 360
AGTTTTAGGA CATTCAGTCT GTTGCATGCC TGAATAAAAA CACTTGTGGT TTGTGTTCTC 420
GCCTAGCTTT TCACAGCAAC TGCAACATCA CTGCACCAGG AGCGTCAGTA AAGACCAAGA 480
AGAAGAAGAA GAAACACAGC ACTGAGCCTG AAAGCTGATG TACTGTAGGC TGCAAGCAGA 540
ATCCTTTATG ACCCAGAGAT AATTTAATAT GAAAAATGTA TATCAATATA ATAAATGAAT 600
CATATTATTA ATCATATTAT TCATTTTATA AATAATTTTT AACTACATTC AAAAAATAGA 660
AACCTGTTTA CCTTTAATAT GTTTACTTTA ATTAACTTTG ATATATTTTT ACTACTGTAA 720
ACTGGTGTAT AAAATCAGGC CGCTTCAATG CAGACTTTGC ACCCTTAACA GAAGTTCAGA 780
AGCTCAAATC ACATCAAATC ATCAAACGTA ATGACAAACG AGAGATGTTT TTCTGAATAA 840
AATACAATCT TTTTTTGTTT TAATATAAAT GAACAAGGCT AGATAGGTTA GGAAAATTCT 900
AGCAAACGTA TAAGCTAATT GTCATTACAG ACCTTGTGAT AGTAATTTAG CTTATTGAAA 960
GCTGTATATT AGTGATGAAA ACAGCTATTT AGATTCATAC AAACAGAAAT AATGTATTTA 1020
TAAACTTGCA CCTTTCTGCT GTGGACGCCA TCTTGTGGTC AGACGCGGGA ACTCATTCGG 1080
CAGGTGAACT TTTGTGCTTT CTAGCCGTTG AGTGAACACA AAGTCCCTTA AAAAGCCTTC 1140
ACATACATCC AAAAATAACG AAAACATTAA TAAAACTTAA TAATATTAAA TCTGAAAACA 1200
AGAGCCAATG AAAAGTACAT AAATATGACT GAACCATGTA GCCTACCAGA TGATGATACA 1260
AACGGCCATG TGATCTGAAA TCGTGCGTAG ACCAGACTGT AAAATATAGG CATAGACATA 1320
GAAATTGTGA ACGATTTAAT TTACTTTCTA TTATTTACAA TAATAAACTT TTTTAAACTT 1380
ATATTCCTAA TATCTACGTG AGCAGTTAGC ACTGTACGTG TAATTAAACA GCATGCACTT 1440
ACATTGCTTG GGCCACTAAT AGAAAATATA TGAGTCAATT TTATTATTTT AATTTAATTA 1500
ATTTCTAAAT AGCTGTACAT TTTACAAAGT CAAACCTTGT CAAACCAATC TTGCTCATTT 1560
AGCATTATTA TTACAGTTTC GTGAATTATA AATTAATTGA TTTAAACTTC ATTATTATTA 1620
TTATTATAAT AATTATTATT TTAACTATGT TTATTATTAT TATTAATTAT TTATTATTTA 1680
TATGTTGAGA TGAGATGAAT CGTTTACTCA CGTGATTCAG ATTGGCGATT CAAATTGTGG 1740
TTGCTATAGC AACGCGTGTT ATGATTTGAC TCCATATATA AACACCGAGA CTCGCCGCTA 1800
TCTGTTGATT GAGGAGAGGC GAATTTCTGA GACATTTGCT GAGGATTACT GTGCTGATAC 1860
TGCGATTCTT CAAGGAGACC AGAGAATTTC TGACAGAAGA CTTTTATTTT ACAAGGAGAT 1920
CGACGCTCAG AGCTGAAATT ATTCCTTTTG ACACGTTTTG TTGCTCTTTT GTTGTGTTTA 1980
TTTTGATTTT GATCTTGTTT TTATTGACAT TTTTATTGAT ATTTGATCTT TGTTCTTGTT 2040
TTCAGGTTTG CTGGAGTTTG GAGGAGTTTG TCAGATGGGT GAAAACCGCA GTGAGTGTTT 2100
TAGTTTTTAT TTGTTTATGA TCAATCATGA TATGATGTTG TGTAATGTTT GGGGAAATGT 2160
GATGTAAATA AACTGGTACA AATGAACCCA TTTCAACACA ACTGTTCCCC GATATAAGTG 2220
ATCAGATGTC TTTTATTCTC TGTAGATGCA GCTACTAAAG TTAATTGTTG ATTAATTCTT 2280
ATAATCTTAT AATAAACGTG ATATGTTGTT GTTGTTGTCG TTGTCTCAGG CCGCTCCAGA 2340
TCCAGGAGTT CTGCTTTCAT CCAGGCAGCT GTTCAGGACG TCAGGACACA TGATGGTGAT 2400
GGTGAAACCC AGACCGTGAG CCAAGAGCTT GATGGATTTC TCGCACCTCT 2450