EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-00319 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:13864275-13865723 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:13864981-13864992AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:13864980-13864991TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr1:13865151-13865165TATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr1:13865149-13865165ATTATTAATTATTTAT-6.2
PROP1MA0715.1chr1:13864980-13864991TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:13864980-13864991TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:13864980-13864991TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr1:13865229-13865245GGTTGCTATAGCAACG+6.82
RFX1MA0509.2chr1:13865229-13865245GGTTGCTATAGCAACG-6.82
RFX2MA0600.2chr1:13865229-13865245GGTTGCTATAGCAACG-7.37
RFX2MA0600.2chr1:13865229-13865245GGTTGCTATAGCAACG+7.4
RFX3MA0798.1chr1:13865229-13865245GGTTGCTATAGCAACG-7.17
RFX3MA0798.1chr1:13865229-13865245GGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX4MA0799.1chr1:13865229-13865245GGTTGCTATAGCAACG-6.65
RFX4MA0799.1chr1:13865229-13865245GGTTGCTATAGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr1:13865229-13865245GGTTGCTATAGCAACG+7.59
RFX5MA0510.2chr1:13865229-13865245GGTTGCTATAGCAACG-7.71
Enhancer Sequence
AATCACATCA AATCATCAAA CGTAATGACA AACGAGAGAT GTTTTTCTGA ATAAAATACA 60
ATCTTTTTTT GTTTTAATAT AAATGAACAA GGCTAGATAG GTTAGGAAAA TTCTAGCAAA 120
CGTATAAGCT AATTGTCATT ACAGACCTTG TGATAGTAAT TTAGCTTATT GAAAGCTGTA 180
TATTAGTGAT GAAAACAGCT ATTTAGATTC ATACAAACAG AAATAATGTA TTTATAAACT 240
TGCACCTTTC TGCTGTGGAC GCCATCTTGT GGTCAGACGC GGGAACTCAT TCGGCAGGTG 300
AACTTTTGTG CTTTCTAGCC GTTGAGTGAA CACAAAGTCC CTTAAAAAGC CTTCACATAC 360
ATCCAAAAAT AACGAAAACA TTAATAAAAC TTAATAATAT TAAATCTGAA AACAAGAGCC 420
AATGAAAAGT ACATAAATAT GACTGAACCA TGTAGCCTAC CAGATGATGA TACAAACGGC 480
CATGTGATCT GAAATCGTGC GTAGACCATA GACTGTAAAA TATAGGCATA GACATAGAAA 540
TTGTGAACGA TTTAATTTAC TTTCTATTAT TTACAATAAT AAACTTTTTT TAACTTATAT 600
TCCTAATATC TACGTGAGCA GTTAGCACTG TACGTGTAAT TAAACAGCAT GCACTTACAT 660
TGCTTGGGCC ACTAATAGAA AATATATGAG TCAATTTTAT TATTTTAATT TAATTAATTC 720
CTAAATAGCT GTACATTTTA CAAAGTCAAA CCTTGTCAAA CCAATCTTGC TCATTTAGCA 780
TTATTATTAC AGTTTCGTGA ATTATAAATT AATTGATTTA AACTTCATTA TTATTATTAT 840
TATAATAATT ATTATTTTAA CTATGTTTAT TATTATTATT AATTATTTAT TATTTATATG 900
TTGAGATGAG ATGAATCGTT TACTCACGTG ATTCAGATTG GCGATTCAAA TTGTGGTTGC 960
TATAGCAACG CGTGTTATGA TTTGACTCCA TATATAAACA CCGAGACTCG CCGCTATCTG 1020
TTGATTGAGG AGAGGCGAAT TTCTGAGACA TTTGCTGAGG ATTACTGTGC TGATACTGCG 1080
ATTCTTCAAG GAGACCAGAG AATTTCTGAC AGAAGACTTT TATTTTACAA GGAGATCGAC 1140
GCTCAGAGCT GAAATTATTC CTTTTGACAC GTTTTGTTGC TCTTTTGTTG TGTTTATTTT 1200
GATTTTGATC TTGTTTTTAT TGACATTTTT ATTGATATTT GATCTTTGTT CTTGTTTTCA 1260
GGTTTGCTGG AGTTTGGAGG AGTTTGTCAG ATGGGTGAAA ACCGCAGTGA GTGTTTTAGT 1320
TTTTATTTGT TTATGATCAA TCATGATATG ATGTTGTGTA ATGTTTGGGG AAATGTGATG 1380
TAAATAAACT GGTACAAATG AACCCATTTC AACACAACTG TTCCCCGATA TAAGTGATCA 1440
GATGTCTT 1448